Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  2
• Reference
  J:39566 Higgins DC, et al., An additional 150 SSLP markers typed for the AXB and BXA recombinant inbred mouse strains. Mamm Genome. 1997;8(11):846-9
• ID
  MGI:1307061

Genes

Gene	Assay Type
D2Mit82	PCR amplified length variant
D2Mit295	PCR amplified length variant
D2Mit367	PCR amplified length variant
D2Mit241	PCR amplified length variant
D2Mit90	PCR amplified length variant
D2Mit56	PCR amplified length variant
D2Mit15	PCR amplified length variant
D2Mit184	PCR amplified length variant
D2Mit62	PCR amplified length variant
D2Mit401	PCR amplified length variant
D2Mit423	PCR amplified length variant
D2Mit340	PCR amplified length variant
D2Mit311	PCR amplified length variant
D2Mit229	PCR amplified length variant
D2Mit414	PCR amplified length variant
D2Mit344	PCR amplified length variant
D2Mit113	PCR amplified length variant
D2Mit148	PCR amplified length variant
D2Mit266	PCR amplified length variant

RI

• Origin
  A/J x C57BL/6J
• Designation
  AXB
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25
D2Mit82	B	A	A	A	A	A	B	A	A	B	A	A	A	A	A	.	B	A	A	A	A	.	A	A	.
D2Mit295	B	A	A	A	A	A	B	A	A	B	B	A	A	A	A	.	B	A	A	A	A	.	A	A	.
D2Mit367	B	A	A	A	A	A	A	A	A	B	B	A	A	A	A	.	A	A	B	A	A	.	A	A	.
D2Mit241	B	A	A	A	A	A	A	A	A	B	B	A	A	A	A	.	A	A	A	A	A	.	A	A	.
D2Mit90	B	A	B	A	A	A	B	A	B	B	B	B	B	B	A	.	A	B	B	A	A	.	A	B	.
D2Mit56	B	A	Z	A	A	A	B	A	A	B	B	B	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	A	B	.
D2Mit15	B	A	B	A	A	A	B	A	A	B	B	A	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	A	A	.
D2Mit184	A	A	B	A	A	A	B	A	A	B	A	A	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	A	A	.
D2Mit62	A	B	B	A	A	A	B	A	A	B	A	A	B	B	A	.	A	B	B	B	B	.	A	A	.
D2Mit401	A	B	B	A	A	A	B	A	A	B	B	A	B	B	A	.	A	B	B	B	B	.	A	A	.
D2Mit423	A	B	B	A	B	A	B	B	A	B	B	A	B	B	A	.	A	B	B	B	B	.	A	A	.
D2Mit340	A	B	B	A	B	A	B	B	A	B	B	A	B	B	A	.	A	B	B	B	B	.	A	A	.
D2Mit311	B	B	B	A	B	B	B	B	A	A	B	B	B	B	A	.	B	B	B	B	B	.	B	A	.
D2Mit229	B	B	B	A	B	B	B	A	A	A	B	B	B	B	A	.	B	B	B	B	B	.	B	A	.
D2Mit414	B	B	B	A	B	B	B	A	A	A	B	B	B	B	A	.	B	B	B	B	B	.	B	A	.
D2Mit344	B	B	B	A	B	B	B	A	A	A	B	B	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	B	A	.
D2Mit113	B	B	B	A	B	B	B	A	A	A	A	B	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	A	A	.
D2Mit148	B	B	A	A	B	B	B	A	A	B	A	B	B	B	A	.	B	B	B	B	A	.	A	A	.
D2Mit266	B	A	B	A	A	B	B	A	A	B	A	B	B	B	A	.	B	B	B	B	B	.	B	A	.

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit82	D2Mit295	1	22	1.220	1.279
D2Mit295	D2Mit367	3	22	4.286	2.891
D2Mit367	D2Mit241	1	22	1.220	1.279
D2Mit241	D2Mit90	9	22	26.471	17.555
D2Mit90	D2Mit56	3	21	4.545	3.092
D2Mit56	D2Mit15	2	21	2.778	2.180
D2Mit15	D2Mit184	2	22	2.632	2.054
D2Mit184	D2Mit62	3	22	4.286	2.891
D2Mit62	D2Mit401	0	22	0.000	0.000
D2Mit401	D2Mit423	3	22	4.286	2.891
D2Mit423	D2Mit340	0	22	0.000	0.000
D2Mit340	D2Mit311	6	22	11.538	6.798
D2Mit311	D2Mit229	1	22	1.220	1.279
D2Mit229	D2Mit414	0	22	0.000	0.000
D2Mit414	D2Mit344	1	22	1.220	1.279
D2Mit344	D2Mit113	2	22	2.632	2.054
D2Mit113	D2Mit148	2	22	2.632	2.054
D2Mit148	D2Mit266	5	22	8.621	5.142