Gene | Allele | Assay Type | Description |
---|---|---|---|
D17Tu1 | PCR amplified length variant | D17Tu1-pA, D17Tu1-pB | |
Dynlt1b | Southern analysis | Tctex-1 | |
D17Mit19 | |||
D17Aus9 | Southern analysis | Au9 | |
T | Southern analysis | T probe 4 | |
D17Leh119 | Southern analysis | Tu119 | |
D17Mit18 | |||
D17Mit25a | |||
D17Pri2 | PCR amplified length variant | D17Pri2-pA, D17Pri2-pB | |
D17Pri3 | PCR amplified length variant | D17Pri-pA, D17Pri3-pB | |
D17Tu34 | Southern analysis | Tu34 | |
Map3k4 | |||
Plg | Southern analysis | pMP33B | |
Thbs2 | Southern analysis | Thbs-2 | |
D17Aus53 | Southern analysis | Au53 | |
D17Aus17 | Southern analysis | Au17 | |
D17Leh55 | Southern analysis | Tu55 | |
Ccnb1-rs3 | Southern analysis | Cyc-B | |
D17Leh80 | Southern analysis | Tu80 | |
D17Leh111 | Southern analysis | Tu111 | |
D17Pri1 | Southern analysis | p71RI1.5 | |
D17Tu50 | Southern analysis | Tu50 | |
D17Leh54 | Southern analysis | p54M | |
D17Lon1 | Southern analysis | p12M | |
D17Lon2 | Southern analysis | p92M | |
D17Aus126 | Southern analysis | P126 | |
D17Mit26 | |||
D17Mit46 | |||
Hba-ps4 | Southern analysis | Hba-9 | |
D17Aus57 | |||
D17Mit44 | |||
Pim1 | |||
D17Aus7 | |||
D17Mit45 | |||
Cryaa | Southern analysis | Crya-10 | |
D17Aus127 | |||
D17Mit28 | |||
D17Mit16 | |||
H2-Ab1 | |||
Lta | |||
D17Mit13 | |||
H2-M2 | |||
D17Leh171 | Southern analysis | D17Leh171 | |
D17Tu49 | Southern analysis | Tu49 | |
D17Mit47 | |||
Tcte1 | Southern analysis | Tcte-1 | |
D17Mit35 | |||
Mea1 | Southern analysis | Mea1 cDNA | |
D17Mit36 | |||
D17Mit10 | |||
D17Mit37 | |||
D17Mit9 | |||
D17Mit6 | |||
C3 | |||
D17Mit4 | |||
D17Mit5 | |||
D17Mit7 |
MC #mice | D17Tu1 | Dynlt1b | D17Mit19 | D17Aus9 | T | D17Leh119 | D17Mit18 | D17Mit25a | D17Pri2 | D17Pri3 | D17Tu34 | Map3k4 | Plg | Thbs2 | D17Aus53 | D17Aus17 | D17Leh55 | Ccnb1-rs3 | D17Leh80 | D17Leh111 | D17Pri1 | D17Tu50 | D17Leh54 | D17Lon1 | D17Lon2 | D17Aus126 | D17Mit26 | D17Mit46 | Hba-ps4 | D17Aus57 | D17Mit44 | Pim1 | D17Aus7 | D17Mit45 | Cryaa | D17Aus127 | D17Mit28 | D17Mit16 | H2-Ab1 | Lta | D17Mit13 | H2-M2 | D17Leh171 | D17Tu49 | D17Mit47 | Tcte1 | D17Mit35 | Mea1 | D17Mit36 | D17Mit10 | D17Mit37 | D17Mit9 | D17Mit6 | C3 | D17Mit4 | D17Mit5 | D17Mit7 |
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124 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
130 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
8 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
3 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
5 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
7 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
6 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
4 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
4 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
11 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c |
11 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b |
2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b |
4 | b | b | b | b | bb | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c |
Marker 1 | Marker 2 | # Recombinants | Total | % Recombinants | Std Error |
---|---|---|---|---|---|
D17Tu1 | Dynlt1b | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
Dynlt1b | D17Mit19 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit19 | D17Aus9 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Aus9 | T | 6 | 369 | 1.626 | 0.658 |
T | D17Leh119 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
D17Leh119 | D17Mit18 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit18 | D17Mit25a | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit25a | D17Pri2 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
D17Pri2 | D17Pri3 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Pri3 | D17Tu34 | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
D17Tu34 | Map3k4 | 10 | 369 | 2.710 | 0.845 |
Map3k4 | Plg | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
Plg | Thbs2 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
Thbs2 | D17Aus53 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Aus53 | D17Aus17 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Aus17 | D17Leh55 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
D17Leh55 | Ccnb1-rs3 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
Ccnb1-rs3 | D17Leh80 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Leh80 | D17Leh111 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Leh111 | D17Pri1 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Pri1 | D17Tu50 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Tu50 | D17Leh54 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Leh54 | D17Lon1 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
D17Lon1 | D17Lon2 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Lon2 | D17Aus126 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
D17Aus126 | D17Mit26 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit26 | D17Mit46 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit46 | Hba-ps4 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
Hba-ps4 | D17Aus57 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Aus57 | D17Mit44 | 17 | 369 | 4.607 | 1.091 |
D17Mit44 | Pim1 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
Pim1 | D17Aus7 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Aus7 | D17Mit45 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit45 | Cryaa | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
Cryaa | D17Aus127 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
D17Aus127 | D17Mit28 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Mit28 | D17Mit16 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
D17Mit16 | H2-Ab1 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
H2-Ab1 | Lta | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
Lta | D17Mit13 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit13 | H2-M2 | 8 | 369 | 2.168 | 0.758 |
H2-M2 | D17Leh171 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Leh171 | D17Tu49 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Tu49 | D17Mit47 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit47 | Tcte1 | 13 | 369 | 3.523 | 0.960 |
Tcte1 | D17Mit35 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit35 | Mea1 | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
Mea1 | D17Mit36 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit36 | D17Mit10 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
D17Mit10 | D17Mit37 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit37 | D17Mit9 | 11 | 369 | 2.981 | 0.885 |
D17Mit9 | D17Mit6 | 6 | 369 | 1.626 | 0.658 |
D17Mit6 | C3 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
C3 | D17Mit4 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit4 | D17Mit5 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit5 | D17Mit7 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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last database update 08/02/2024 MGI 6.24 |
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