Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  4
• Reference
  J:54496 Rogers MJ, et al., Genetic mapping of the whirler mutation. Mamm Genome. 1999 May;10(5):513-9
• ID
  MGI:1336960

Genes

Gene	Assay Type	Description
D4Mit5
D4Mit38
D4Nds10
D4Mit6
D4Mit88
D4Mit112
D4Mit163
D4Mit215
D4Mit274
D4Mit139
D4Mit140
D4Mit197
D4Mit242
D4Mit288
D4Mit44
D4Mit151
D4Mit217
Alad	Southern analysis	Lv cDNA4
Zfp37	Southern analysis	Zfp37 cDNA2
D4Mit243
D4Mit287
D4Mit326
Whrn	visible phenotype
D4Mit87
Orm1
D4Mit218
Tnc	Southern analysis	Tnc cDNA2
D4Mit82
D4Mit25
D4Nds9
D4Ler2	Southern analysis	D4Ler2 genomic
D4Mit7
D4Mit132
D4Mit141
D4Mit83
D4Mit86
D4Mit142
D4Mit275
D4Mit80
D4Mit114
D4Mit115
D4Mit174
Tyrp1
D4Mit143
D4Mit166
D4Mit173
D4Mit185
D4Mit186
D4Mit297
D4Nds7

CROSS

• Type
  Backcross, sexes unspecified or combined
• Female Parent
  <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  (STOCK Whrn x CAST/Ei)F1
• Male Parent
  <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>/<w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>
• Strain
  STOCK Whrn
• Allele 1
  w from STOCK Whrn
• Allele 2
  c from CAST/EiJ

CROSS Data

MC #mice	D4Mit5	D4Mit38	D4Nds10	D4Mit6	D4Mit88	D4Mit112	D4Mit163	D4Mit215	D4Mit274	D4Mit139	D4Mit140	D4Mit197	D4Mit242	D4Mit288	D4Mit44	D4Mit151	D4Mit217	Alad	Zfp37	D4Mit243	D4Mit287	D4Mit326	Whrn	D4Mit87	Orm1	D4Mit218	Tnc	D4Mit82	D4Mit25	D4Nds9	D4Ler2	D4Mit7	D4Mit132	D4Mit141	D4Mit83	D4Mit86	D4Mit142	D4Mit275	D4Mit80	D4Mit114	D4Mit115	D4Mit174	Tyrp1	D4Mit143	D4Mit166	D4Mit173	D4Mit185	D4Mit186	D4Mit297	D4Nds7
60	c	c	c	c	c	c	c	.	.	c	c	.	.	.	c	c	c	c	c	.	.	.	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	.	.	.	c	c	c	c	c	.	.	.	.	.	.	.
43	w	w	w	w	w	w	w	.	.	w	w	.	.	.	w	w	w	w	w	.	.	.	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	.	.	.	w	w	w	w	w	.	.	.	.	.	.	.
2	c	c	w	w	w	w	w	.	.	w	w	.	.	.	w	w	w	w	w	.	.	.	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	.	.	.	w	w	w	w	w	.	.	.	.	.	.	.
1	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
2	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D4Mit5	D4Mit38	0	118	0.000	0.000
D4Mit38	D4Nds10	3	118	2.542	1.449
D4Nds10	D4Mit6	0	118	0.000	0.000
D4Mit6	D4Mit88	0	118	0.000	0.000
D4Mit88	D4Mit112	0	118	0.000	0.000
D4Mit112	D4Mit163	0	118	0.000	0.000
D4Mit139	D4Mit140	0	118	0.000	0.000
D4Mit44	D4Mit151	0	118	0.000	0.000
D4Mit151	D4Mit217	0	118	0.000	0.000
D4Mit217	Alad	0	118	0.000	0.000
Alad	Zfp37	0	118	0.000	0.000
Whrn	D4Mit87	0	118	0.000	0.000
D4Mit87	Orm1	0	118	0.000	0.000
Orm1	D4Mit218	1	118	0.847	0.844
D4Mit218	Tnc	0	118	0.000	0.000
Tnc	D4Mit82	1	118	0.847	0.844
D4Mit82	D4Mit25	1	118	0.847	0.844
D4Mit25	D4Nds9	0	118	0.000	0.000
D4Nds9	D4Ler2	2	118	1.695	1.188
D4Ler2	D4Mit7	0	118	0.000	0.000
D4Mit7	D4Mit132	1	118	0.847	0.844
D4Mit132	D4Mit141	0	118	0.000	0.000
D4Mit80	D4Mit114	0	118	0.000	0.000
D4Mit114	D4Mit115	0	118	0.000	0.000
D4Mit115	D4Mit174	0	118	0.000	0.000
D4Mit174	Tyrp1	0	118	0.000	0.000