Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  15
• Reference
  J:49829 Taylor BA, et al., Genotyping new BXD recombinant inbred mouse strains and comparison of BXD and consensus maps. Mamm Genome. 1999 Apr;10(4):335-48
• ID
  MGI:1343312

Genes

Gene	Assay Type
D15Mit13	PCR amplified length variant
D15Mit53	PCR amplified length variant
D15Mit111	PCR amplified length variant
D15Mit232	PCR amplified length variant
D15Mit63	PCR amplified length variant
D15Mit29	PCR amplified length variant
D15Mit71	PCR amplified length variant
D15Mit158	PCR amplified length variant
D15Mit189	PCR amplified length variant
D15Mit159	PCR amplified length variant
D15Mit34	PCR amplified length variant
D15Mit42	PCR amplified length variant
D15Mit16	PCR amplified length variant
D15Mit15	PCR amplified length variant

RI

• Origin
  C57BL/6J x DBA/2J
• Designation
  BXD
• Abbreviation 1
  B
• Abbreviation 2
  D

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	5	6	8	9	11	12	13	14	15	16	18	19	20	21	22	23	24	25	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
D15Mit13	B	D	B	B	B	D	B	B	B	D	B	B	D	B	B	D	B	B	D	D	D	D	B	D	B	B	B	B	D	B	B	B	B	B	B	D
D15Mit53	B	D	D	B	B	D	B	B	B	D	B	B	D	B	B	D	B	B	D	D	D	D	B	D	B	B	D	D	D	B	B	B	B	B	B	D
D15Mit111	B	D	B	B	B	D	B	B	B	D	B	B	D	B	B	D	B	B	D	B	D	D	B	D	B	B	D	D	D	B	B	D	B	B	B	D
D15Mit232	B	D	B	B	B	D	B	B	B	D	B	B	D	D	B	D	B	B	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	D	.	D	.	B	B	.	D
D15Mit63	B	B	B	B	D	D	B	B	D	D	B	B	D	D	B	D	B	B	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	D	.	D	.	B	D	.	B
D15Mit29	B	B	B	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	B	D	B	B
D15Mit71	B	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	B	D	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	B	D	B	B
D15Mit158	B	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	B	D	B	B
D15Mit189	B	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	D	B	D	B	B
D15Mit159	B	D	B	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	B	D	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	B	B	.	D	B
D15Mit34	B	D	B	B	D	D	B	B	D	B	B	B	D	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	B	B	B	D	B
D15Mit42	B	B	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	B	D	D	D	B	B	B	B	D	B
D15Mit16	D	B	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	D	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	B	.	B	D	D	D	B	B	B	B	D	B
D15Mit15	D	B	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	D	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	B	D	B	D	D	D	B	B	B	B	D	B

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D15Mit13	D15Mit53	3	36	2.381	1.504
D15Mit53	D15Mit111	3	36	2.381	1.504
D15Mit111	D15Mit232	3	33	2.632	1.677
D15Mit232	D15Mit63	5	33	4.902	2.613
D15Mit63	D15Mit29	4	33	3.704	2.122
D15Mit29	D15Mit71	4	36	3.333	1.886
D15Mit71	D15Mit158	1	36	0.725	0.746
D15Mit158	D15Mit189	1	36	0.725	0.746
D15Mit189	D15Mit159	8	35	8.696	4.109
D15Mit159	D15Mit34	3	35	2.459	1.558
D15Mit34	D15Mit42	9	36	10.000	4.619
D15Mit42	D15Mit16	2	35	1.562	1.173
D15Mit16	D15Mit15	0	35	0.000	0.000