Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  17
• Reference
  J:49829 Taylor BA, et al., Genotyping new BXD recombinant inbred mouse strains and comparison of BXD and consensus maps. Mamm Genome. 1999 Apr;10(4):335-48
• ID
  MGI:1343314

Genes

Gene	Assay Type
D17Mit113	PCR amplified length variant
D17Mit133	PCR amplified length variant
D17Mit135	PCR amplified length variant
D17Mit16	PCR amplified length variant
D17Mit28	PCR amplified length variant
D17Mit11	PCR amplified length variant
D17Mit49	PCR amplified length variant
D17Mit66	PCR amplified length variant
D17Mit20	PCR amplified length variant
D17Mit89	PCR amplified length variant
D17Mit152	PCR amplified length variant
D17Mit39	PCR amplified length variant
D17Mit41	PCR amplified length variant
D17Mit129	PCR amplified length variant

RI

• Origin
  C57BL/6J x DBA/2J
• Designation
  BXD
• Abbreviation 1
  B
• Abbreviation 2
  D

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	5	6	8	9	11	12	13	14	15	16	18	19	20	21	22	23	24	25	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
D17Mit113	D	D	D	D	B	B	B	D	B	B	B	B	D	B	B	B	B	B	D	B	B	D	B	D	D	D	D	D	D	B	D	D	D	B	.	B
D17Mit133	D	B	D	D	B	B	B	D	B	B	B	B	D	B	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	D	D	D	D	D	B	.	D	D	B	B	B
D17Mit135	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	B	D	D	B	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	D	D	D	D	D	D	.	D	D	D	B	B
D17Mit16	D	B	D	D	B	D	D	D	B	B	B	D	D	B	B	D	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	D	D	D	D	B	D	B	D	B	B
D17Mit28	D	B	D	D	B	D	D	D	B	B	B	D	D	B	B	D	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	D	D	D	D	B	D	B	D	B	B
D17Mit11	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	B	D	D	B	B	D	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	D	D	D	D	B	D	D	D	D	B
D17Mit49	D	B	D	D	B	B	D	B	D	B	B	D	D	B	B	B	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	D	D	D	D	B	D	B	D	D	D
D17Mit66	D	D	D	D	B	B	D	B	D	B	B	D	D	B	B	B	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	D	D	D	D	D	D	B	D	D	D
D17Mit20	D	D	B	B	B	B	D	B	D	B	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	B
D17Mit89	D	B	B	B	B	B	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	B
D17Mit152	D	B	B	B	B	B	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	B
D17Mit39	B	B	D	B	B	B	D	D	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D
D17Mit41	B	D	B	B	B	B	D	B	D	D	B	B	D	B	D	D	B	B	D	D	D	D	B	B	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D
D17Mit129	B	D	B	B	B	B	D	B	B	D	B	B	D	B	D	D	B	B	D	D	D	D	B	D	B	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D17Mit113	D17Mit133	4	34	3.571	2.037
D17Mit133	D17Mit135	6	35	5.769	2.886
D17Mit135	D17Mit16	3	35	2.459	1.558
D17Mit16	D17Mit28	0	36	0.000	0.000
D17Mit28	D17Mit11	3	36	2.381	1.504
D17Mit11	D17Mit49	5	36	4.386	2.299
D17Mit49	D17Mit66	2	36	1.515	1.136
D17Mit66	D17Mit20	6	36	5.556	2.761
D17Mit20	D17Mit89	2	36	1.515	1.136
D17Mit89	D17Mit152	0	36	0.000	0.000
D17Mit152	D17Mit39	9	36	10.000	4.619
D17Mit39	D17Mit41	9	36	10.000	4.619
D17Mit41	D17Mit129	3	36	2.381	1.504