Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  1
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1351999

Genes

Gene	Assay Type	Description
D1Mit373
D1Rik117	RLGS	NaSM81
D1Mit212
D1Rik118	RLGS	NaSM134
D1Rik119	RLGS	NaA151
D1Rik120	RLGS	NaSM11
D1Rik121	RLGS	NaA130
D1Rik122	RLGS	NaSM42
D1Rik123	RLGS	NaSM185
D1Rik124	RLGS	NaSM40
D1Rik125	RLGS	NaA43
D1Rik126	RLGS	NaSM146
D1Rik127	RLGS	NaA176
D1Rik128	RLGS	NaSM179
D1Rik129	RLGS	NdA125
D1Rik130	RLGS	NdSM270
D1Rik131	RLGS	NdSM179
D1Rik132	RLGS	NdA128
D1Rik133	RLGS	NaA133
D1Rik134	RLGS	NdA36
D1Rik135	RLGS	NdSM59
D1Mit13
D1Mit262
D1Rik136	RLGS	NdSM144
D1Rik137	RLGS	NdSM216
D1Rik138	RLGS	NdA159
D1Mit102
D1Rik139	RLGS	NaSM116
D1Rik140	RLGS	NaA131
D1Rik141	RLGS	NaSM166
D1Rik142	RLGS	NaA191
D1Rik143	RLGS	NaSM61
D1Rik144	RLGS	NaA60
D1Rik145	RLGS	NaA121
D1Rik146	RLGS	NaSM5
D1Rik147	RLGS	NaA94
D1Rik148	RLGS	NaSM111
D1Rik149	RLGS	NaA125
D1Rik150	RLGS	NdSM136
D1Rik151	RLGS	NdA93
D1Rik152	RLGS	NdSM231
D1Mit14
D1Rik153	RLGS	NdSM132
D1Rik154	RLGS	NdA97
D1Rik155	RLGS	NaA47
D1Rik156	RLGS	NdSM275
D1Rik157	RLGS	NdA200
D1Rik158	RLGS	NaSM62
D1Rik159	RLGS	NA62
D1Rik160	RLGS	NdSM155
D1Rik161	RLGS	NdA115
D1Rik162	RLGS	NaSM178
D1Rik163	RLGS	NdA208

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D1Mit373	S	S	S	A	S	A	A	A	A	S	S	S	A	S	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	A	A	A	S
D1Rik117	S	S	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	S	A	A	A	S
D1Mit212	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	S	A	A	A	S
D1Rik118	S	S	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	A	S	A	.	A	.	S	A	A	S	A	.	A	S
D1Rik119	S	S	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	A	S	A	.	A	.	S	A	A	S	A	.	A	S
D1Rik120	S	.	S	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	S	S	A	S	S	A	A	S
D1Rik121	S	A	S	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	S	S	A	S	S	A	A	S
D1Rik122	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	S
D1Rik123	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	S	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik124	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik125	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik126	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik127	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik128	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik129	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik130	S	A	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D1Rik131	S	A	S	S	A	S	A	S	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	S	A	S	S	S	A	A	S
D1Rik132	S	A	S	S	A	S	A	S	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	S	A	S	S	S	A	A	S
D1Rik133	S	A	S	S	A	S	A	S	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	S
D1Rik134	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	S	A	A	A	S	S	S	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	A
D1Rik135	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	S	A	A	A	S	S	S	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	A
D1Mit13	S	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	S	A	S	.	A	.	S	S	S	A	A	A	S	A
D1Mit262	S	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	S	.	A	.	S	S	A	A	A	A	S	A
D1Rik136	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	A	A	S	S	A
D1Rik137	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	A	A	S	S	A
D1Rik138	S	A	S	S	A	A	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	A	A	S	S	A
D1Mit102	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik139	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik140	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik141	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik142	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik143	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik144	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik145	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik146	S	A	S	.	.	A	A	A	S	S	A	S	S	A	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik147	S	A	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	S	A
D1Rik148	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik149	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik150	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik151	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik152	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Mit14	S	A	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik153	S	A	S	S	S	A	A	S	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik154	S	A	S	S	S	A	A	S	S	S	A	S	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik155	S	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	S	S	S	A	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik156	S	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	S	S	S	A	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik157	S	A	S	S	A	A	A	S	S	S	A	S	S	S	A	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D1Rik158	A	S	S	A	A	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A
D1Rik159	A	S	S	A	A	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A
D1Rik160	A	S	S	A	A	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A
D1Rik161	A	S	S	A	A	S	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A
D1Rik162	A	S	S	A	A	S	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A
D1Rik163	A	S	S	A	A	S	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	A	.	S	S	A	S	S	S	A	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D1Mit373	D1Rik117	4	26	5.000	2.990
D1Rik117	D1Mit212	1	26	1.020	1.062
D1Mit212	D1Rik118	3	25	3.659	2.416
D1Rik118	D1Rik119	0	25	0.000	0.000
D1Rik119	D1Rik120	6	24	10.000	5.657
D1Rik120	D1Rik121	0	25	0.000	0.000
D1Rik121	D1Rik122	5	26	6.757	3.817
D1Rik122	D1Rik123	3	26	3.488	2.291
D1Rik123	D1Rik124	1	26	1.020	1.062
D1Rik124	D1Rik125	0	26	0.000	0.000
D1Rik125	D1Rik126	0	26	0.000	0.000
D1Rik126	D1Rik127	0	26	0.000	0.000
D1Rik127	D1Rik128	0	26	0.000	0.000
D1Rik128	D1Rik129	0	26	0.000	0.000
D1Rik129	D1Rik130	0	26	0.000	0.000
D1Rik130	D1Rik131	3	26	3.488	2.291
D1Rik131	D1Rik132	0	26	0.000	0.000
D1Rik132	D1Rik133	3	26	3.488	2.291
D1Rik133	D1Rik134	6	26	8.824	4.832
D1Rik134	D1Rik135	0	26	0.000	0.000
D1Rik135	D1Mit13	7	26	11.290	6.119
D1Mit13	D1Mit262	3	26	3.488	2.291
D1Mit262	D1Rik136	4	26	5.000	2.990
D1Rik136	D1Rik137	0	26	0.000	0.000
D1Rik137	D1Rik138	0	26	0.000	0.000
D1Rik138	D1Mit102	6	26	8.824	4.832
D1Mit102	D1Rik139	0	26	0.000	0.000
D1Rik139	D1Rik140	0	26	0.000	0.000
D1Rik140	D1Rik141	0	26	0.000	0.000
D1Rik141	D1Rik142	0	26	0.000	0.000
D1Rik142	D1Rik143	0	26	0.000	0.000
D1Rik143	D1Rik144	0	26	0.000	0.000
D1Rik144	D1Rik145	0	26	0.000	0.000
D1Rik145	D1Rik146	1	24	1.111	1.160
D1Rik146	D1Rik147	1	24	1.111	1.160
D1Rik147	D1Rik148	6	26	8.824	4.832
D1Rik148	D1Rik149	0	26	0.000	0.000
D1Rik149	D1Rik150	0	26	0.000	0.000
D1Rik150	D1Rik151	0	26	0.000	0.000
D1Rik151	D1Rik152	0	26	0.000	0.000
D1Rik152	D1Mit14	0	26	0.000	0.000
D1Mit14	D1Rik153	1	26	1.020	1.062
D1Rik153	D1Rik154	0	26	0.000	0.000
D1Rik154	D1Rik155	2	26	2.174	1.670
D1Rik155	D1Rik156	0	26	0.000	0.000
D1Rik156	D1Rik157	0	26	0.000	0.000
D1Rik157	D1Rik158	9	26	18.000	10.091
D1Rik158	D1Rik159	0	26	0.000	0.000
D1Rik159	D1Rik160	0	26	0.000	0.000
D1Rik160	D1Rik161	1	26	1.020	1.062
D1Rik161	D1Rik162	0	26	0.000	0.000
D1Rik162	D1Rik163	0	26	0.000	0.000