Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  2
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352256

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Rik101	RLGS	NdSM6
D2Rik102	RLGS	NaSM128
D2Rik103	RLGS	NaA101
D2Rik104	RLGS	NdSM242
D2Rik105	RLGS	NdA163
D2Rik106	RLGS	NdSM101
D2Mit156
D2Rik107	RLGS	NaSM46
D2Rik108	RLGS	NdSM45
D2Rik109	RLGS	NaSM117
D2Rik110	RLGS	NaA129
D2Rik111	RLGS	NaSM45
D2Rik112	RLGS	NdSM208
D2Rik113	RLGS	NdSM145
D2Rik114	RLGS	NdA114
D2Mit102
D2Rik115	RLGS	NaA19
D2Rik116	RLGS	NaSM60
D2Rik117	RLGS	NaA170
D2Mit78
D2Rik118	RLGS	NaSM147
D2Rik119	RLGS	NaA177
D2Rik120	RLGS	NdSM265
D2Rik121	RLGS	NdA197
D2Mit28
D2Mit281
D2Rik122	RLGS	NaSM145
D2Rik123	RLGS	NaA175
D2Rik124	RLGS	NaA213
D2Rik125	RLGS	NdSM86
D2Rik126	RLGS	NaA46
D2Rik127	RLGS	NdSM210
D2Rik128	RLGS	NdA142
D2Rik129	RLGS	NdA107
D2Rik130	RLGS	NdA194
D2Rik131	RLGS	NaSM28
D2Rik132	RLGS	NaA31
D2Rik133	RLGS	NdSM176
D2Mit148
D2Rik134	RLGS	NdA146
D2Rik135	RLGS	NdSM201

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D2Rik101	S	.	S	A	S	A	S	S	A	A	S	.	S	.	S	S	.	.	S	.	.	A	A	A	A	A	S	S
D2Rik102	.	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	.	S	A	S	S	S	.	A	.	A	S	S	A	S	.	S	S
D2Rik103	.	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	.	S	A	S	S	S	.	A	.	A	S	S	A	S	.	S	S
D2Rik104	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	S	S	S	.	A	.	A	S	S	A	S	A	S	S
D2Rik105	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	S	S	S	.	A	.	A	S	S	A	S	A	S	S
D2Rik106	S	A	S	A	A	A	S	S	A	A	S	S	S	A	S	S	A	.	S	.	A	S	S	A	S	A	S	A
D2Mit156	S	A	S	A	S	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	.	S	.	S	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik107	S	A	S	A	S	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	.	S	.	S	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik108	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D2Rik109	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik110	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik111	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik112	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	A
D2Rik113	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	A	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	A
D2Rik114	S	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	A	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	A
D2Mit102	A	A	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	A	S	S	.	A	.	A	S	S	S	A	A	A	A
D2Rik115	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Rik116	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Rik117	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	.	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Mit78	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Rik118	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Rik119	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D2Rik120	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	S
D2Rik121	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	S
D2Mit28	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	S
D2Mit281	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	A	A	A	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik122	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik123	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik124	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	.	S
D2Rik125	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik126	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik127	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik128	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik129	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik130	A	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	A	A	S	S	S	A	S	S
D2Rik131	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D2Rik132	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D2Rik133	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	S	.	S	S	A	A	A	S	S	S
D2Mit148	S	A	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	.	S	.	A	S	A	A	S	S	S	A
D2Rik134	S	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	A	A	S	S	S	A
D2Rik135	S	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	A	A	S	S	S	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Rik101	D2Rik102	4	19	7.692	4.995
D2Rik102	D2Rik103	0	23	0.000	0.000
D2Rik103	D2Rik104	0	23	0.000	0.000
D2Rik104	D2Rik105	0	26	0.000	0.000
D2Rik105	D2Rik106	4	26	5.000	2.990
D2Rik106	D2Mit156	9	26	18.000	10.091
D2Mit156	D2Rik107	0	26	0.000	0.000
D2Rik107	D2Rik108	8	26	14.286	7.805
D2Rik108	D2Rik109	1	26	1.020	1.062
D2Rik109	D2Rik110	0	26	0.000	0.000
D2Rik110	D2Rik111	0	26	0.000	0.000
D2Rik111	D2Rik112	0	26	0.000	0.000
D2Rik112	D2Rik113	4	26	5.000	2.990
D2Rik113	D2Rik114	0	26	0.000	0.000
D2Rik114	D2Mit102	3	26	3.488	2.291
D2Mit102	D2Rik115	3	26	3.488	2.291
D2Rik115	D2Rik116	0	26	0.000	0.000
D2Rik116	D2Rik117	0	25	0.000	0.000
D2Rik117	D2Mit78	0	25	0.000	0.000
D2Mit78	D2Rik118	0	26	0.000	0.000
D2Rik118	D2Rik119	0	26	0.000	0.000
D2Rik119	D2Rik120	1	26	1.020	1.062
D2Rik120	D2Rik121	0	26	0.000	0.000
D2Rik121	D2Mit28	0	26	0.000	0.000
D2Mit28	D2Mit281	7	26	11.290	6.119
D2Mit281	D2Rik122	3	26	3.488	2.291
D2Rik122	D2Rik123	0	26	0.000	0.000
D2Rik123	D2Rik124	0	25	0.000	0.000
D2Rik124	D2Rik125	0	25	0.000	0.000
D2Rik125	D2Rik126	1	26	1.020	1.062
D2Rik126	D2Rik127	0	26	0.000	0.000
D2Rik127	D2Rik128	0	26	0.000	0.000
D2Rik128	D2Rik129	0	26	0.000	0.000
D2Rik129	D2Rik130	0	26	0.000	0.000
D2Rik130	D2Rik131	3	26	3.488	2.291
D2Rik131	D2Rik132	0	26	0.000	0.000
D2Rik132	D2Rik133	4	26	5.000	2.990
D2Rik133	D2Mit148	8	26	14.286	7.805
D2Mit148	D2Rik134	2	26	2.174	1.670
D2Rik134	D2Rik135	0	26	0.000	0.000