Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  11
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352415

Genes

Gene	Assay Type	Description
D11Rik115	RLGS	NdSM71
D11Rik116	RLGS	NaA85
D11Mit80
D11Rik117	RLGS	NaSM36
D11Rik118	RLGS	NaA77
D11Rik119	RLGS	NaSM183
D11Rik120	RLGS	NaA203
D11Rik121	RLGS	NaSM187
D11Mit140
D11Rik122	RLGS	NaA127
D11Rik123	RLGS	NdSM141
D11Rik124	RLGS	NdA116
D11Rik125	RLGS	NaSM72
D11Rik126	RLGS	NaA72
D11Rik127	RLGS	NaSM2
D11Rik128	RLGS	NaA4
D11Rik129	RLGS	NaA194
D11Rik130	RLGS	NaA180
D11Rik131	RLGS	NdSM190
D11Rik132	RLGS	NdSM114
D11Rik133	RLGS	NdA79
D11Rik134	RLGS	NaA82
D11Rik135	RLGS	NaSM92
D11Rik136	RLGS	NaA97
D11Rik137	RLGS	NaSM102
D11Rik138	RLGS	NaA113
D11Rik139	RLGS	NaSM158
D11Rik140	RLGS	NaA154
D11Rik141	RLGS	NaA84
D11Rik142	RLGS	NdA187
D11Rik143	RLGS	NdA192
D11Rik144	RLGS	NaSM181
D11Rik145	RLGS	NaA81
D11Rik146	RLGS	NaA158
D11Mit12
D11Rik147	RLGS	NdSM283
D11Rik148	RLGS	NdA205

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D11Rik115	A	A	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	A	A	A	S	.	A	.	S	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik116	A	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	S	A	A	A	A	S	.	A	.	S	S	S	A	A	S	A	A
D11Mit80	S	A	S	A	S	A	A	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	A	.	S	S	S	A	A	S	S	A
D11Rik117	S	A	S	A	S	A	A	A	S	A	S	A	S	A	S	A	S	.	A	.	S	S	S	A	A	S	S	A
D11Rik118	S	A	S	A	S	A	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	S	.	A	.	S	S	S	A	A	S	S	A
D11Rik119	S	A	S	A	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	S	S	S	A	S	A	S
D11Rik120	S	A	S	A	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	S	S	S	A	S	A	S
D11Rik121	S	A	S	A	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	S	S	S	A	S	A	S
D11Mit140	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	A	A	S	S	S	A	S
D11Rik122	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	A	A	S	S	S	A	S
D11Rik123	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	A	A	S	S	S	A	S
D11Rik124	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	A	A	A	S	A	S	.	A	.	S	A	A	S	S	S	A	S
D11Rik125	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik126	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik127	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik128	S	S	S	.	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik129	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik130	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik131	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	.	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik132	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik133	S	S	S	A	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	S	.	S	A	S	S	S	S	S	S
D11Rik134	S	A	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	S	.	S	A	A	S	S	S	S	S
D11Rik135	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	S	.	S	A	A	A	S	.	S	S
D11Rik136	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	S	.	S	A	A	A	S	.	S	S
D11Rik137	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik138	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik139	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik140	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	.	A	A
D11Rik141	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik142	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik143	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik144	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	S	S	S	A	S	A	A
D11Rik145	S	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	A	A	.	S	.	A	S	S	S	A	S	S	A
D11Rik146	S	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	S	S	S	A	A	.	S	.	S	S	S	S	A	.	S	A
D11Mit12	S	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	S	S	S	S	A	.	S	.	S	S	S	S	A	S	S	A
D11Rik147	S	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	S	S	S	A	.	S	.	S	S	S	S	A	S	S	A
D11Rik148	S	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	A	S	S	S	S	A	.	S	.	S	S	S	S	A	S	S	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D11Rik115	D11Rik116	3	26	3.488	2.291
D11Rik116	D11Mit80	4	26	5.000	2.990
D11Mit80	D11Rik117	3	26	3.488	2.291
D11Rik117	D11Rik118	3	26	3.488	2.291
D11Rik118	D11Rik119	5	26	6.757	3.817
D11Rik119	D11Rik120	0	26	0.000	0.000
D11Rik120	D11Rik121	0	26	0.000	0.000
D11Rik121	D11Mit140	6	26	8.824	4.832
D11Mit140	D11Rik122	0	26	0.000	0.000
D11Rik122	D11Rik123	0	26	0.000	0.000
D11Rik123	D11Rik124	0	26	0.000	0.000
D11Rik124	D11Rik125	5	26	6.757	3.817
D11Rik125	D11Rik126	0	26	0.000	0.000
D11Rik126	D11Rik127	0	26	0.000	0.000
D11Rik127	D11Rik128	0	25	0.000	0.000
D11Rik128	D11Rik129	0	25	0.000	0.000
D11Rik129	D11Rik130	0	26	0.000	0.000
D11Rik130	D11Rik131	0	25	0.000	0.000
D11Rik131	D11Rik132	1	25	1.064	1.109
D11Rik132	D11Rik133	0	26	0.000	0.000
D11Rik133	D11Rik134	4	26	5.000	2.990
D11Rik134	D11Rik135	3	25	3.659	2.416
D11Rik135	D11Rik136	0	25	0.000	0.000
D11Rik136	D11Rik137	10	25	25.000	15.309
D11Rik137	D11Rik138	0	26	0.000	0.000
D11Rik138	D11Rik139	0	26	0.000	0.000
D11Rik139	D11Rik140	0	25	0.000	0.000
D11Rik140	D11Rik141	0	25	0.000	0.000
D11Rik141	D11Rik142	0	26	0.000	0.000
D11Rik142	D11Rik143	0	26	0.000	0.000
D11Rik143	D11Rik144	0	26	0.000	0.000
D11Rik144	D11Rik145	5	26	6.757	3.817
D11Rik145	D11Rik146	2	25	2.273	1.752
D11Rik146	D11Mit12	1	25	1.064	1.109
D11Mit12	D11Rik147	2	26	2.174	1.670
D11Rik147	D11Rik148	0	26	0.000	0.000