Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  12
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352417

Genes

Gene	Assay Type	Description
D12Mit56	RLGS
D12Rik68	RLGS	NaSM156
D12Rik69	RLGS	NaA184
D12Mit58
D12Rik70	RLGS	NaSM115
D12Rik71	RLGS	NaA124
D12Rik72	RLGS	NaA19
D12Rik73	RLGS	NaA21
D12Rik74	RLGS	NaA90
D12Rik75	RLGS	NaA63
D12Rik76	RLGS	NdSM138
D12Rik77	RLGS	NdSM139
D12Rik78	RLGS	NdA8
D12Rik79	RLGS	NdA96
D12Rik80	RLGS	NaA98
D12Rik81	RLGS	NaSM137
D12Mit112
D12Rik82	RLGS	NaSM186
D12Rik83	RLGS	NaA123
D12Rik84	RLGS	NdA193
D12Rik85	RLGS	NaSM182
D12Rik86	RLGS	NaA200
D12Rik87	RLGS	NdSM260
D12Rik88	RLGS	NaSM124
D12Rik89	RLGS	NaA137
D12Rik90	RLGS	NaSM142
D12Rik91	RLGS	NdSM102
D12Rik92	RLGS	NdA73

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D12Mit56	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik68	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik69	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	S	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Mit58	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik70	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik71	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik72	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik73	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik74	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik75	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik76	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik77	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik78	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	.	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik79	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik80	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Rik81	A	S	S	A	.	A	S	A	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	S	.	S	S	S	S	S	A	A	S
D12Mit112	A	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	A	A	A	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	S
D12Rik82	A	A	S	S	A	S	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	S
D12Rik83	A	A	S	S	A	S	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	S
D12Rik84	A	A	S	S	A	S	S	S	.	A	S	A	A	.	A	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	A
D12Rik85	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	A	A	A	S	S	S	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	S
D12Rik86	A	A	S	S	A	S	S	S	S	A	S	A	A	A	S	S	S	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	S
D12Rik87	A	A	S	S	A	S	S	S	S	S	S	A	A	A	S	S	S	.	A	.	S	S	S	A	S	A	A	S
D12Rik88	A	S	S	S	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	A	S	.	A	A
D12Rik89	A	S	S	S	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	A	S	.	A	A
D12Rik90	A	S	S	S	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	A	S	.	A	.	A	S	S	S	S	A	A	A
D12Rik91	A	S	S	S	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	A	S	.	A	.	A	S	S	S	S	A	A	A
D12Rik92	A	S	S	S	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	A	S	.	A	.	A	S	S	S	S	A	A	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D12Mit56	D12Rik68	0	26	0.000	0.000
D12Rik68	D12Rik69	0	26	0.000	0.000
D12Rik69	D12Mit58	1	26	1.020	1.062
D12Mit58	D12Rik70	0	26	0.000	0.000
D12Rik70	D12Rik71	0	26	0.000	0.000
D12Rik71	D12Rik72	0	26	0.000	0.000
D12Rik72	D12Rik73	0	26	0.000	0.000
D12Rik73	D12Rik74	0	26	0.000	0.000
D12Rik74	D12Rik75	0	26	0.000	0.000
D12Rik75	D12Rik76	0	26	0.000	0.000
D12Rik76	D12Rik77	0	26	0.000	0.000
D12Rik77	D12Rik78	0	25	0.000	0.000
D12Rik78	D12Rik79	0	25	0.000	0.000
D12Rik79	D12Rik80	0	26	0.000	0.000
D12Rik80	D12Rik81	4	25	5.263	3.174
D12Rik81	D12Mit112	7	25	12.069	6.674
D12Mit112	D12Rik82	3	26	3.488	2.291
D12Rik82	D12Rik83	0	26	0.000	0.000
D12Rik83	D12Rik84	1	24	1.111	1.160
D12Rik84	D12Rik85	3	24	3.846	2.557
D12Rik85	D12Rik86	0	26	0.000	0.000
D12Rik86	D12Rik87	1	26	1.020	1.062
D12Rik87	D12Rik88	10	25	25.000	15.309
D12Rik88	D12Rik89	0	25	0.000	0.000
D12Rik89	D12Rik90	2	25	2.273	1.752
D12Rik90	D12Rik91	0	26	0.000	0.000
D12Rik91	D12Rik92	0	26	0.000	0.000