Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  15
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352423

Genes

Gene	Assay Type	Description
D15Mit130
D15Mit85
D15Rik51	RLGS	NdSM88
D15Mit241
D15Rik52	RLGS	NaSM07
D15Rik53	RLGS	NaA183
D15Rik54	RLGS	NaA161
D15Rik55	RLGS	NaA36
D15Rik56	RLGS	NdSM223
D15Rik57	RLGS	NdA166
D15Rik58	RLGS	NaSM66
D15Rik59	RLGS	NaA65
D15Rik60	RLGS	NaSM164
D15Rik61	RLGS	NaA190
D15Rik62	RLGS	NaA147
D15Rik63	RLGS	NaA205
D15Mit161

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D15Mit130	A	A	S	A	A	S	S	A	S	A	S	S	A	S	A	S	A	.	S	.	A	S	A	S	S	A	A	S
D15Mit85	A	S	S	S	A	S	A	A	A	A	S	S	A	S	A	S	S	.	S	.	A	S	A	S	A	S	S	A
D15Rik51	A	S	S	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	A	S	A	S	.	S	.	S	S	S	A	S	A	S	S
D15Mit241	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D15Rik52	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D15Rik53	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	.	A	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D15Rik54	S	A	A	A	S	S	.	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	.	A	.	S	S	A	S	A	.	S	A
D15Rik55	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	.	S	A	A	.	A	.	S	S	S	S	A	.	S	A
D15Rik56	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	A	S	A	A	.	A	.	S	S	S	S	A	S	S	A
D15Rik57	S	A	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	A	S	A	A	.	A	.	S	S	S	S	A	S	S	A
D15Rik58	S	S	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Rik59	S	S	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Rik60	S	S	.	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Rik61	S	S	.	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Rik62	S	S	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Rik63	S	S	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D15Mit161	S	S	A	A	S	S	A	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	.	A	.	S	S	S	S	S	S	S	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D15Mit130	D15Mit85	9	26	18.000	10.091
D15Mit85	D15Rik51	12	26	37.500	25.817
D15Rik51	D15Mit241	13	26	50.000	39.223
D15Mit241	D15Rik52	0	26	0.000	0.000
D15Rik52	D15Rik53	0	26	0.000	0.000
D15Rik53	D15Rik54	0	24	0.000	0.000
D15Rik54	D15Rik55	2	23	2.500	1.943
D15Rik55	D15Rik56	0	24	0.000	0.000
D15Rik56	D15Rik57	0	26	0.000	0.000
D15Rik57	D15Rik58	9	26	18.000	10.091
D15Rik58	D15Rik59	0	26	0.000	0.000
D15Rik59	D15Rik60	0	25	0.000	0.000
D15Rik60	D15Rik61	0	25	0.000	0.000
D15Rik61	D15Rik62	0	25	0.000	0.000
D15Rik62	D15Rik63	0	26	0.000	0.000
D15Rik63	D15Mit161	2	26	2.174	1.670