Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  16
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352425

Genes

Gene	Assay Type	Description
D16Rik43	RLGS	NaA33
D16Rik44	RLGS	NaA201
D16Rik45	RLGS	NaSM22
D16Rik46	RLGS	NaA25
D16Rik47	RLGS	NdSM196
D16Rik48	RLGS	NdA143
D16Rik49	RLGS	NaSM190
D16Rik50	RLGS	NaA182
D16Rik51	RLGS	NdA184
D16Rik52	RLGS	NaA211
D16Rik53	RLGS	NaSM125
D16Rik54	RLGS	NaA138
D16Mit15
D16Rik55	RLGS	NdSM131
D16Rik56	RLGS	NdSM267
D16Rik57	RLGS	NdA203
D16Rik58	RLGS	NdSM134
D16Rik59	RLGS	NdA92
D16Mit7
D16Rik60	RLGS	NaA135
D16Rik61	RLGS	NaSM141

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D16Rik43	S	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	S	A	A	A	S	A	.	S	.	A	S	A	A	A	S	S	S
D16Rik44	S	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	S	A	A	A	S	A	.	S	.	A	S	A	A	A	S	S	S
D16Rik45	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	S	A	.	S	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D16Rik46	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	S	A	.	S	.	S	S	A	S	A	S	S	A
D16Rik47	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	S	A	A	A	S	S	A
D16Rik48	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	S	A	A	A	S	S	A
D16Rik49	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	S	A	A	A	S	S	A
D16Rik50	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	S	A	A	A	S	A	A
D16Rik51	S	S	A	A	S	S	S	S	S	S	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	S	A	A	A	S	A	A
D16Rik52	S	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	S	A	A
D16Rik53	S	S	A	A	S	A	S	S	S	A	S	S	A	S	A	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	.	A	S
D16Rik54	S	S	A	A	S	A	S	S	S	A	S	.	A	S	A	A	A	.	A	.	S	A	A	A	A	.	A	S
D16Mit15	A	S	A	A	A	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	S	A	S
D16Rik55	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	A	S
D16Rik56	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	A	S
D16Rik57	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	A	S
D16Rik58	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	S	S
D16Rik59	A	S	A	A	A	A	S	S	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	S	S
D16Mit7	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	S	S
D16Rik60	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	.	S	S
D16Rik61	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	S	A	S	A	S	S	S	S

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D16Rik43	D16Rik44	0	26	0.000	0.000
D16Rik44	D16Rik45	8	26	14.286	7.805
D16Rik45	D16Rik46	0	26	0.000	0.000
D16Rik46	D16Rik47	5	26	6.757	3.817
D16Rik47	D16Rik48	0	26	0.000	0.000
D16Rik48	D16Rik49	0	26	0.000	0.000
D16Rik49	D16Rik50	1	26	1.020	1.062
D16Rik50	D16Rik51	0	26	0.000	0.000
D16Rik51	D16Rik52	2	26	2.174	1.670
D16Rik52	D16Rik53	2	25	2.273	1.752
D16Rik53	D16Rik54	0	24	0.000	0.000
D16Rik54	D16Mit15	6	24	10.000	5.657
D16Mit15	D16Rik55	6	26	8.824	4.832
D16Rik55	D16Rik56	0	26	0.000	0.000
D16Rik56	D16Rik57	0	26	0.000	0.000
D16Rik57	D16Rik58	5	26	6.757	3.817
D16Rik58	D16Rik59	0	26	0.000	0.000
D16Rik59	D16Mit7	1	26	1.020	1.062
D16Mit7	D16Rik60	0	25	0.000	0.000
D16Rik60	D16Rik61	0	25	0.000	0.000