Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  18
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352436

Genes

Gene	Assay Type	Description
D18Rik39	RLGS	NaA17
D18Rik40	RLGS	NaSM30
D18Rik41	RLGS	NaA32
D18Rik42	RLGS	NdSM219
D18Rik43	RLGS	NaSM191
D18Rik44	RLGS	NaA215
D18Rik45	RLGS	NdSM251
D18Rik46	RLGS	NdA191
D18Rik47	RLGS	NaSM118
D18Mit34
D18Rik48	RLGS	NdSM293
D18Rik49	RLGS	NdA12
D18Mit139
D18Rik50	RLGS	NaSM4
D18Rik51	RLGS	NaA6
D18Rik52	RLGS	NaSM26
D18Rik53	RLGS	NaA26
D18Rik54	RLGS	NaSM79
D18Rik55	RLGS	NaA78
D18Rik56	RLGS	NaSM93
D18Rik57	RLGS	NaA100
D18Rik58	RLGS	NaSM75
D18Rik59	RLGS	NaA75

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D18Rik39	S	S	A	.	A	A	A	.	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	S	S	A	S	S	A	S	A
D18Rik40	A	S	S	A	S	A	A	S	A	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	S	A
D18Rik41	A	S	S	A	S	A	A	S	A	A	.	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	S	A
D18Rik42	A	S	S	A	S	A	A	S	A	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	S	A
D18Rik43	A	A	S	A	S	A	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	A
D18Rik44	A	A	S	A	S	A	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	A
D18Rik45	A	A	S	A	S	A	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	A
D18Rik46	A	A	S	A	S	A	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	A	S	A	A	A
D18Rik47	A	S	S	A	S	A	A	S	A	A	S	S	S	S	A	S	S	.	A	.	S	S	A	A	A	.	A	A
D18Mit34	A	S	S	A	S	S	A	S	A	A	S	A	A	S	S	S	S	.	A	.	S	S	A	S	A	A	A	A
D18Rik48	S	S	S	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	.	S	.	S	.	A	A	A	A	S	A
D18Rik49	S	S	S	A	S	S	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	.	S	.	S	.	A	A	A	A	S	A
D18Mit139	S	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	S	S	A	S	A	S	.	S	.	S	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik50	S	S	S	.	.	A	A	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik51	S	S	S	.	.	A	A	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik52	S	S	S	S	.	A	A	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik53	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik54	S	S	S	S	A	S	A	A	S	S	S	S	A	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	.	A	S
D18Rik55	S	S	S	S	A	S	A	A	S	S	S	S	A	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	A	A	S
D18Rik56	S	S	S	S	A	S	A	A	S	S	S	S	A	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	.	A	S
D18Rik57	S	S	S	S	A	S	A	A	S	S	S	S	A	S	S	S	S	.	A	.	A	S	A	S	A	.	A	S
D18Rik58	S	S	S	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	S	S	S	S	.	S	.	A	S	A	S	A	A	A	A
D18Rik59	S	S	S	S	S	A	S	A	S	A	S	S	A	S	S	S	S	.	S	.	A	S	A	S	A	A	A	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D18Rik39	D18Rik40	6	24	10.000	5.657
D18Rik40	D18Rik41	0	25	0.000	0.000
D18Rik41	D18Rik42	0	25	0.000	0.000
D18Rik42	D18Rik43	3	26	3.488	2.291
D18Rik43	D18Rik44	0	26	0.000	0.000
D18Rik44	D18Rik45	0	26	0.000	0.000
D18Rik45	D18Rik46	0	26	0.000	0.000
D18Rik46	D18Rik47	5	25	7.143	4.082
D18Rik47	D18Mit34	5	25	7.143	4.082
D18Mit34	D18Rik48	7	24	12.963	7.331
D18Rik48	D18Rik49	0	24	0.000	0.000
D18Rik49	D18Mit139	10	24	27.778	17.891
D18Mit139	D18Rik50	4	24	5.556	3.381
D18Rik50	D18Rik51	0	24	0.000	0.000
D18Rik51	D18Rik52	0	24	0.000	0.000
D18Rik52	D18Rik53	0	25	0.000	0.000
D18Rik53	D18Rik54	3	25	3.659	2.416
D18Rik54	D18Rik55	0	25	0.000	0.000
D18Rik55	D18Rik56	0	25	0.000	0.000
D18Rik56	D18Rik57	0	25	0.000	0.000
D18Rik57	D18Rik58	6	25	9.375	5.213
D18Rik58	D18Rik59	0	26	0.000	0.000