Mapping Data

Experiment

• Experiment
  TEXT-Genetic Cross
• Chromosome
  13
• Reference
  J:69924 Benavides F, et al., The CD4 T cell-deficient mouse mutation nackt (nkt) involves a deletion in the cathepsin L (CtsI) gene. Immunogenetics. 2001 Apr;53(3):233-42
• ID
  MGI:2136160

Genes

Gene	Allele	Assay Type
D13Mit21
D13Mit23
D13Mit250
D13Mit141
D13Mit279
D13Mit142
D13Mit157
Ctsl	Ctsl^nkt	visible phenotype
D13Mit7
D13Mit39
D13Mit209
D13Mit281

Notes

• Experiment
  The authors genotyped 247 F2 mice derived from three intercrosses (NKT/Pas x MAI/Pas, NKT/Pas x MBT/Pas, NKT/Pas x CAST/Ei) to narrow the nkt region to a 1 cM region between D13Mit142 and D13Mit281. Haplotype analysis revealed the order and distance of markers to be: D13Mit21, D13Mit23, D13Mit250 - 0.8 +/- 0.4 - D13Mit141, D13Mit279 - 0.2 +/- 0.2 - D13Mit142, D13Mit157 - 0.4 +/- 0.3 - Ctsl, D13Mit7, D13Mit39, D13Mit209 - 0.6 +/- 0.3 - D13Mit281.