Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  11
• Reference
  J:156851 Golas A, Microsatellite differences on Chromosome 3, 6, 11 and 12 in C57BL/6J and 129/Sv strains and Mapping in CBXE RI line. MGI Direct Data Submission. 2010;
• ID
  MGI:4430109

Genes

Gene	Assay Type
D11Mit78	PCR
D11Mit79	PCR
D11Mit151	PCR
D11Mit230	PCR
D11Mit130	PCR
D11Mit153	PCR
D11Mit310	PCR
D11Mit242	PCR
D11Mit156	PCR
D11Mit41	PCR
D11Mit168	PCR
D11Mit48	PCR

Notes

• Reference
  Strains 61, 62, 64 and 66 are a new CBXE RI set.
• Experiment
  The . indicated in the haplotypes is equivalent to RI strain typing as heterozygous
  Strains 61, 62, 64 and 66 are a new CBXE RI set.

RI

• Origin
  CBA/Kw x KE
• Designation
  CBXE
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  E

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	61	62	64	66
D11Mit78	C	C	C	C
D11Mit79	C	C	E	C
D11Mit151	C	C	E	C
D11Mit230	C	C	E	C
D11Mit130	C	C	E	E
D11Mit153	C	C	.	E
D11Mit310	C	C	E	E
D11Mit242	C	.	E	C
D11Mit156	C	.	E	C
D11Mit41	E	E	E	E
D11Mit168	E	C	E	C
D11Mit48	E	C	E	E

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D11Mit78	D11Mit79	1	4	10.000	13.856
D11Mit79	D11Mit151	0	4	0.000	0.000
D11Mit151	D11Mit230	0	4	0.000	0.000
D11Mit230	D11Mit130	1	4	10.000	13.856
D11Mit130	D11Mit153	0	3	0.000	0.000
D11Mit153	D11Mit310	0	3	0.000	0.000
D11Mit310	D11Mit242	1	3	16.667	27.217
D11Mit242	D11Mit156	0	3	0.000	0.000
D11Mit41	D11Mit168	2	4	50.000	100.000
D11Mit168	D11Mit48	1	4	10.000	13.856