Mapping Data

Experiment

• Experiment
  TEXT-Genetic Cross
• Chromosome
  17
• Reference
  J:20144 Heine D, et al., Analysis of recombinational hot spots associated with the p haplotype of the mouse MHC. Genomics. 1994 Sep 1;23(1):168-77
• ID
  MGI:44462

Genes

Gene	Assay Type	Description
D17Mit23	PCR amplified length variant	d106
D17Mit81	PCR amplified length variant	MMH169
D17Mit60	PCR amplified length variant	MPC361
D17Mit61	PCR amplified length variant	MPC402
D17Rua3	PCR amplified length variant	D17Rua3-pA, D17Rua3-pB
D17Mit63	PCR amplified length variant	MPC1645
D17Mit62	PCR amplified length variant	MPC1728
D17Mit82	PCR amplified length variant	MPC2560
D17Mit83	PCR amplified length variant	D979
D17Mit16	PCR amplified length variant	A25
D17Mit28	PCR amplified length variant	D545
D17Mit21	PCR amplified length variant	D21
D17Mit22	PCR amplified length variant	D16
D17Rua2	PCR amplified length variant	D17Rua2-pA, D17Rua2-pB
D17Mit34	PCR amplified length variant	D521
D17Nds2	PCR amplified length variant	28.MMHSP68L
D17Nds3	PCR amplified length variant	22.MMTNFAB
D17Mit13	PCR amplified length variant	I57
D17Rua7	PCR amplified length variant	D17Rua7-pA, D17Rua7-pB
D17Rua9	PCR amplified length variant	D17Rua9-pA, D17Rua9-pB
D17Mit47	PCR amplified length variant	D589
D17Mit24	PCR amplified length variant	D12
D17Rua1	PCR amplified length variant	D17Rua1-pA, D17Rua1-pB
D17Mit11	PCR amplified length variant	M145

Notes

• Reference
  In this reference the authors used PCR-based markers found within anchor loci to map recombination hot spots on Chromosome 17. The markers and corresponding loci (provided in parenthesis) are: D17Mit23 (Pim1), D17Rua3 (Crya1), D17Mit28 (H2-K), D17Mit21 (H2-Ab), D17Mt22 (H2-Eb), D17Rua2 (H2-Ea), D17Mit34 (H2-S referred to in text as C4-Slp), D17Nds2 (Hsp70-1), D17Nds3 (Tnfb), D17Rua7 (H2-D), D17Rua9 (H2-Q1), D17Rua5 (H2-M4), D7Rua6 (H2-M6), D17Mit24 (H2-M2) and D17Rua1 (Tpx1).
• Experiment
  Progeny from the (C3H.NB x B10.D2(o)) x B10.D2(o) backcross were typed for microsatellite markers within the major histocompatibility complex. The order and genetic distances of loci in this region are: D17Mit23 - 0.55 cM - D17Mit81- D17Mit60 - D17Mit61 - 3.0 cM - D17Rua3 - 0.55 cM - D17Mit63 - 0.83 cM - D17Mit62 - D17Mit82 - D17Mit83 - D17Mit28 - D17Mit16 - D17Mit21 - D17Mit22 - D17Rua2 - D17Mit34 - D17Nds24 - 0.27 cM - D17Mit13 - D17Nds3 - 0.55 cM - D17Rua7 - D17Rua9 - D17Mit24 - D17Mit47 - 0.27cM - D17Rua1 - 0.55 cM - D17Mit11. The typing data has been submitted to MGD accession # MGD-CREX-139.