Mapping Data

Experiment

• Experiment
  TEXT-Physical Mapping
• Chromosome
  11
• Reference
  J:28409 Segre JA, et al., Positional cloning of the nude locus: genetic, physical, and transcription maps of the region and mutations in the mouse and rat. Genomics. 1995 Aug 10;28(3):549-59
• ID
  MGI:46222

Genes

Gene	Assay Type	Description
D11Seg47	Southern analysis	RDA10.4, WI FAL G2
D11Seg4	PCR amplified length variant	D11Seg4-pA, D11Seg4-pB, WI FAL G2
D11Seg8	PCR amplified length variant	D11Seg8-pA, D11Seg8-pB, WI FAL G2
D11Seg20	PCR amplified length variant	D11Seg20-pA, D11Seg20-pB, WI FAL G2
D11Seg23	PCR amplified length variant	D11Seg23-pA, D11Seg23-pB, WI FAL G2
D11Seg29	PCR amplified length variant	D11Seg29-pA, D11Seg29-pB, WI FAL G2, WI FEL D9
D11Seg30	PCR amplified length variant	D11Seg30-pA, D11Seg30-pB, WI FAL G2, WI FEL D9
D11Seg41	PCR amplified length variant	D11Seg41-pA, D11Seg41-pB, WI FAL G2, WI FEL D9
D11Seg46	Southern analysis	RDA10.2, WI FAL G2, WI FEL D9
D11Seg43	PCR amplified length variant	D11Seg43-pA, D11Seg43-pB, WI FAL G2, WI FEL D9, WI AAN G1
D11Mit117	PCR amplified length variant	MPC367, WI FEL D9, WI AAN G1
D11Mit144	PCR amplified length variant	D1206, WI FEL D9, WI AAN G1
D11Seg44	PCR amplified length variant	D11Seg44-pA, D11Seg44-pB, WI FAL G2, WI FEL D9, WI AAN G1, WI FCL F6
D11Mit34	PCR amplified length variant	A1113, WI FCL F6

Notes

• Reference
  The authors use RDA6.2, RDA10.4, RDA10.2, rah GTP, and Ad-Rab for locus symbols D11Seg45, D11Seg46, D11Seg47, Rah1, and D11Seg50 respectively.
• Experiment
  Authors physically mapped the following order of loci to mouse Chromosome 11 using PCR and Southern blot analysis on a series of overlapping YACs: D11Seg47 - D11Seg4 - D11Seg8 - D11Seg20 - D11Seg23 - D11Seg29 - D11Seg30 - D11Seg41 - D11Seg46 - D11Seg43 -D11Mit117 - D11Mit144 - D11Seg44 - D1111Mit34. This region includes approximately 1.6 Mb of genomic sequence.