Mapping Data

Experiment

• Experiment
  TEXT-Physical Mapping
• Chromosome
  11
• Reference
  J:28409 Segre JA, et al., Positional cloning of the nude locus: genetic, physical, and transcription maps of the region and mutations in the mouse and rat. Genomics. 1995 Aug 10;28(3):549-59
• ID
  MGI:46223

Genes

Gene	Assay Type	Description
D11Seg1	PCR amplified length variant	D11Seg1-pA, D11Seg1-pB, P10
D11Seg2	PCR amplified length variant	D11Seg2-pA, D11Seg2-pB, P10, P8, P7
D11Seg3	PCR amplified length variant	D11Seg3-pA, D11Seg3-pB, P7, P8, P9, P10
D11Seg4	PCR amplified length variant	D11Seg4-pA, D11Seg4-pB, P7, P8, P9, P10
D11Seg5	PCR amplified length variant	D11Seg5-pA, D11Seg5-pB, P7, P8, P9, P10
D11Seg6	PCR amplified length variant	D11Seg6-pA, D11Seg6-pB, P7, P8, P9
D11Seg7	PCR amplified length variant	D11Seg7-pA, D11Seg7-pB, P7, P9, P18
D11Seg8	PCR amplified length variant	D11Seg8-pA, D11Seg8-pB, P7, P9, P18, P19
D11Seg9	PCR amplified length variant	D11Seg9-pA, D11Seg9-pB, P18, P19
D11Seg10	PCR amplified length variant	D11Seg10-pA, D11Seg10-pB, P18, P19
D11Seg11	PCR amplified length variant	D11Seg11-pA, D11Seg11-pB, P18, P19, P26
D11Seg12	PCR amplified length variant	D11Seg12-pA, D11Seg12-pB, P18, P19, P26, P28
D11Seg13	PCR amplified length variant	D11Seg13-pA, D11Seg13-pB, P19, P26, P28
D11Seg14	PCR amplified length variant	D11Seg14-pA, D11Seg14-pB, P19, P26, P27, P28
D11Seg15	PCR amplified length variant	D11Seg15-pA, D11Seg15-pB, P22, P26, P27, P28
D11Seg16	PCR amplified length variant	D11Seg16-pA, D11Seg16-pB, P22, P27, P28
D11Seg17	PCR amplified length variant	D11Seg17-pA, D11Seg17-pB, P22, P27, Aldo1
D11Seg18	PCR amplified length variant	D11Seg18-pA, D11Seg18-pB, P12, P22, P23, P27
D11Seg19	PCR amplified length variant	D11Seg19-pA, D11Seg19-pB, P11, P12, P13, P22, P23, P27
D11Seg20	PCR amplified length variant	D11Seg20-pA, D11Seg20-pB, P11,P12, P13, P22, P23, P27
D11Seg21	PCR amplified length variant	D11Seg21-pA, D11Seg21-pB, P11, P12, P13, P22, P23, C2, C7
D11Seg22	PCR amplified length variant	D11Seg22-pA, D11Seg22-pB, P11, P12, P13, P23, C2, C7
D11Seg23	PCR amplified length variant	D11Seg23-pA, D11Seg23-pB, P11, P12, P13, P23, C7
D11Seg24	PCR amplified length variant	D11Seg24-pA, D11Seg24-pB, P11, P13, P23, P24, C7
D11Seg25	PCR amplified length variant	D11Seg25-pA, D11Seg25-pB, P11, P13, P23, P24
D11Seg26	PCR amplified length variant	D11Seg26-pA, D11Seg26-pB, P11, P23, P24, P25
D11Seg27	PCR amplified length variant	D11Seg27-pA, D11Seg27-pB, P21, P24, P25
D11Seg28	PCR amplified length variant	D11Seg28-pA, D11Seg28-pB, P21, P24, P25
D11Seg29	PCR amplified length variant	D11Seg29-pA, D11Seg29-pB, P21, P24, P25
D11Seg30	PCR amplified length variant	D11Seg30-pA, D11Seg30-pB, P14, P21, C1, C10
D11Seg31	PCR amplified length variant	D11Seg31-pA, D11Seg31-pB, P14, P21, C1, C10
D11Seg32	PCR amplified length variant	D11Seg32-pA, D11Seg32-pB, P14, P21, C10
D11Seg33	PCR amplified length variant	D11Seg33-pA, D11Seg33-pB, P14, P21, C10
D11Seg34	PCR amplified length variant	D11Seg34-pA, D11Seg34-pB, P14, P15, C10
D11Seg35	PCR amplified length variant	D11Seg35-pA, D11Seg35-pB, P14, P15, C10
D11Seg36	PCR amplified length variant	D11Seg36-pA, D11Seg36-pB, P14, P15, C8
D11Seg37	PCR amplified length variant	D11Seg37-pA, D11Seg37-pB, P14, P15, C8
D11Seg38	PCR amplified length variant	D11Seg38-pA, D11Seg38-pB, P14, P15, C8
D11Seg39	PCR amplified length variant	D11Seg39-pA, D11Seg39-pB, P1, P14, P15
D11Seg40	PCR amplified length variant	D11Seg40-pA, D11Seg40-pB, P1, P2, P15
D11Seg41	PCR amplified length variant	D11Seg41-pA, D11Seg41-pB, P1, P2, P15
D11Seg42	PCR amplified length variant	D11Seg42-pA< D11Seg42-pB, P1, P2

Notes

• Reference
  The authors use RDA6.2, RDA10.4, RDA10.2, rah GTP, and Ad-Rab for locus symbols D11Seg45, D11Seg46, D11Seg47, Rah1, and D11Seg50 respectively.
• Experiment
  Authors physically mapped the following order of loci through the construction of a P1 contig spanning over 426kb on mouse Chromosome 11: D11Seg1 - D11Seg2 - D11Seg3 - D11Seg4 - D11Seg5 - D11Seg6 - D11Seg7 - D11Seg8 - D11Seg9 - D11Seg10 - D11Seg11 - D11Seg12 - D11Seg13 - D11Seg14 - D11Seg15 - D11Seg16 - D11Seg17 - D11Seg18 - D11Seg19 - D11Seg20 - D11Seg21 - D11Seg22 - D11Seg23 - D11Seg24 - D11Seg25 - D11Seg26 - D11Seg27 - D11Seg28 - D11Seg29 - D11Seg30 - D11Seg31 - D11Seg32 - D11Seg33 - D11Seg34 - D11Seg35 - D11Seg36 - D11Seg37 - D11Seg38 - D11Seg39 - D11Seg40 - D11Seg41 - D11Seg42.