Gene | Allele | Assay Type | Description |
---|---|---|---|
T | visible phenotype | ||
D17Leh119I | Southern analysis | p119A-R | |
D17Leh119II | Southern analysis | p119A-R | |
D17Mit18 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit143 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit164 | PCR amplified length variant | ||
Map3k4 | Southern analysis | pMK174 | |
Sod2 | Southern analysis | pmMnSOD1 | |
D17Mit57 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit113 | PCR amplified length variant | ||
D17Zt6 | PCR amplified length variant | ||
D17Zt7 | PCR amplified length variant | ||
D17Ph2 | restriction analysis | pCO79R | |
D17Ph5e | restriction analysis | pc417 | |
D17Mit78 | PCR amplified length variant | ||
Hst1 | visible phenotype | ||
Tbp | PCR amplified length variant | ||
D17Ph4e | restriction analysis | pc891 | |
D17Ph1 | restriction analysis | pFFEH11R | |
D17Leh80 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit165 | PCR amplified length variant | ||
D17Tu50 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit59 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit133 | PCR amplified length variant | ||
D17Ph3 | restriction analysis | pM10.1 | |
D17Mit43 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit46 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit100 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit173 | PCR amplified length variant | ||
Hba-ps4 | Southern analysis | [a] [g]4 | |
D17Mit30 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit29 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit167 | PCR amplified length variant | ||
Pim1 | Southern analysis | pPim1 | |
D17Mit23 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit45 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit101 | PCR amplified length variant | ||
D17Mit61 | PCR amplified length variant | ||
H2-K1 | Southern analysis | p1954 | |
D17Mit62 | PCR amplified length variant |
MC #mice | T | D17Leh119I | D17Leh119II | D17Mit18 | D17Mit143 | D17Mit164 | Map3k4 | Sod2 | D17Mit57 | D17Mit113 | D17Zt6 | D17Zt7 | D17Ph2 | D17Ph5e | D17Mit78 | Hst1 | Tbp | D17Ph4e | D17Ph1 | D17Leh80 | D17Mit165 | D17Tu50 | D17Mit59 | D17Mit133 | D17Ph3 | D17Mit43 | D17Mit46 | D17Mit100 | D17Mit173 | Hba-ps4 | D17Mit30 | D17Mit29 | D17Mit167 | Pim1 | D17Mit23 | D17Mit45 | D17Mit101 | D17Mit61 | H2-K1 | D17Mit62 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
521 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
695 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
16 | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
22 | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
3 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
3 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
8 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
5 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
12 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
11 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
4 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
6 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
7 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
8 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c |
6 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b |
1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c |
4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b |
1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b |
16 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c |
22 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b |
Marker 1 | Marker 2 | # Recombinants | Total | % Recombinants | Std Error |
---|---|---|---|---|---|
T | D17Leh119I | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Leh119I | D17Leh119II | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Leh119II | D17Mit18 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit18 | D17Mit143 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit143 | D17Mit164 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit164 | Map3k4 | 38 | 1397 | 2.720 | 0.435 |
Map3k4 | Sod2 | 2 | 1397 | 0.143 | 0.101 |
Sod2 | D17Mit57 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit57 | D17Mit113 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit113 | D17Zt6 | 5 | 1397 | 0.358 | 0.160 |
D17Zt6 | D17Zt7 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Zt7 | D17Ph2 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Ph2 | D17Ph5e | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Ph5e | D17Mit78 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit78 | Hst1 | 3 | 1397 | 0.215 | 0.124 |
Hst1 | Tbp | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
Tbp | D17Ph4e | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Ph4e | D17Ph1 | 2 | 1397 | 0.143 | 0.101 |
D17Ph1 | D17Leh80 | 13 | 1397 | 0.931 | 0.257 |
D17Leh80 | D17Mit165 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit165 | D17Tu50 | 4 | 1397 | 0.286 | 0.143 |
D17Tu50 | D17Mit59 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit59 | D17Mit133 | 23 | 1397 | 1.646 | 0.340 |
D17Mit133 | D17Ph3 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Ph3 | D17Mit43 | 6 | 1397 | 0.429 | 0.175 |
D17Mit43 | D17Mit46 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit46 | D17Mit100 | 4 | 1397 | 0.286 | 0.143 |
D17Mit100 | D17Mit173 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit173 | Hba-ps4 | 5 | 1397 | 0.358 | 0.160 |
Hba-ps4 | D17Mit30 | 13 | 1397 | 0.931 | 0.257 |
D17Mit30 | D17Mit29 | 12 | 1397 | 0.859 | 0.247 |
D17Mit29 | D17Mit167 | 7 | 1397 | 0.501 | 0.189 |
D17Mit167 | Pim1 | 4 | 1397 | 0.286 | 0.143 |
Pim1 | D17Mit23 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit23 | D17Mit45 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
D17Mit45 | D17Mit101 | 1 | 1397 | 0.072 | 0.072 |
D17Mit101 | D17Mit61 | 1 | 1397 | 0.072 | 0.072 |
D17Mit61 | H2-K1 | 38 | 1397 | 2.720 | 0.435 |
H2-K1 | D17Mit62 | 0 | 1397 | 0.000 | 0.000 |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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