Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  11
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46496

Genes

Gene	Assay Type
D11Mit71	PCR amplified length variant
D11Mit1	PCR amplified length variant
D11Mit62	PCR amplified length variant
D11Mit2	PCR amplified length variant
D11Mit162	PCR amplified length variant
D11Mit151	PCR amplified length variant
D11Mit19	PCR amplified length variant
D11Mit173	PCR amplified length variant
D11Mit51	PCR amplified length variant
D11Mit174	PCR amplified length variant
D11Mit20	PCR amplified length variant
D11Mit21	PCR amplified length variant
D11Mit22	PCR amplified length variant
D11Mit139	PCR amplified length variant
D11Mit24	PCR amplified length variant
D11Nds9	PCR amplified length variant
D11Mit164	PCR amplified length variant
D11Mit26	PCR amplified length variant
D11Mit4	PCR amplified length variant
D11Mit28	PCR amplified length variant
D11Mit8	PCR amplified length variant
D11Mit36	PCR amplified length variant
D11Mit37	PCR amplified length variant
D11Mit41	PCR amplified length variant
D11Mit122	PCR amplified length variant
D11Mit70	PCR amplified length variant
D11Mit67	PCR amplified length variant
D11Mit98	PCR amplified length variant
D11Mit180	PCR amplified length variant
D11Mit61	PCR amplified length variant
D11Mit167	PCR amplified length variant
D11Mit48	PCR amplified length variant
D11Mit49	PCR amplified length variant
D11Mit104	PCR amplified length variant
D11Nds10	PCR amplified length variant
D11Nds18	PCR amplified length variant
D11Nki1	PCR amplified length variant
Trp53	PCR amplified length variant
Hba	PCR amplified length variant
Mpmv18	PCR amplified length variant
Egfr	PCR amplified length variant
Mpmv4	PCR amplified length variant
Mtv3	PCR amplified length variant
Es3	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D11Mit71	.	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D11Mit1	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit62	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit2	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit162	C	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit151	C	S	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit19	C	S	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit173	C	S	C	S	C	C	S	S	C	Z	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit51	C	S	C	S	C	C	S	.	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit174	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit20	Z	C	S	Z	C	.	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit21	C	C	S	Z	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit22	Z	C	S	Z	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C
D11Mit139	S	C	S	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	.
D11Mit24	Z	C	S	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Nds9	C	C	S	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit164	C	C	S	S	C	C	C	C	S	C	C	C	.	C	S	C	.	C	C	C
D11Mit26	.	C	.	.	.	.	.	C	S	C	C	C	C	C	S	.	C	C	S	S
D11Mit4	C	C	S	S	C	C	C	Z	S	C	C	C	.	C	.	Z	.	C	S	C
D11Mit28	C	C	S	S	C	C	C	Z	S	C	C	C	C	C	S	Z	C	C	Z	C
D11Mit8	C	C	C	S	C	C	C	Z	S	C	C	C	C	C	S	Z	C	C	S	C
D11Mit36	Z	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C
D11Mit37	.	C	C	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	.
D11Mit41	Z	C	C	S	C	.	C	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C
D11Mit122	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit70	C	C	C	S	C	C	C	X	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D11Mit67	C	C	C	S	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit98	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit180	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D11Mit61	C	C	C	S	C	C	C	S	C	.	C	C	S	C	.	.	C	C	.	.
D11Mit167	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D11Mit48	C	.	C	S	C	C	C	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
D11Mit49	C	.	C	S	C	C	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
D11Mit104	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D11Nds10	Z	C	S	Z	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D11Nds18	Z	C	C	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	S	Z	C	C	C	C
D11Nki1	C	C	S	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	S	S	Z	C	C	S	C
Trp53	C	C	S	S	C	C	C	Z	S	C	C	C	C	C	S	S	C	C	S	C
Hba	C	Z	C	Z	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
Mpmv18	C	S	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
Egfr	C	S	Z	C	C	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C
Mpmv4	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C
Mtv3	C	C	C	S	.	.	.	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
Es3	C	C	C	S	C	C	C	S	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	.

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D11Mit71	D11Mit1	0	18	0.000	0.000
D11Mit1	D11Mit62	1	20	1.351	1.424
D11Mit62	D11Mit2	0	20	0.000	0.000
D11Mit2	D11Mit162	2	20	2.941	2.321
D11Mit162	D11Mit151	1	20	1.351	1.424
D11Mit151	D11Mit19	0	20	0.000	0.000
D11Mit19	D11Mit173	2	20	2.941	2.321
D11Mit173	D11Mit51	1	18	1.515	1.606
D11Mit51	D11Mit174	2	18	3.333	2.667
D11Mit174	D11Mit20	3	19	5.172	3.591
D11Mit20	D11Mit21	1	19	1.429	1.510
D11Mit21	D11Mit22	2	20	2.941	2.321
D11Mit22	D11Mit139	2	18	3.333	2.667
D11Mit139	D11Mit24	2	18	3.333	2.667
D11Mit24	D11Nds9	1	20	1.351	1.424
D11Nds9	D11Mit164	2	18	3.333	2.667
D11Mit164	D11Mit26	2	11	6.250	5.497
D11Mit26	D11Mit4	2	10	7.143	6.454
D11Mit4	D11Mit28	1	17	1.613	1.716
D11Mit28	D11Mit8	2	20	2.941	2.321
D11Mit8	D11Mit36	6	20	13.636	8.469
D11Mit36	D11Mit37	3	18	5.556	3.904
D11Mit37	D11Mit41	3	17	6.000	4.275
D11Mit41	D11Mit122	4	19	7.692	4.995
D11Mit122	D11Mit70	1	19	1.429	1.510
D11Mit70	D11Mit67	0	18	0.000	0.000
D11Mit67	D11Mit98	0	19	0.000	0.000
D11Mit98	D11Mit180	0	19	0.000	0.000
D11Mit180	D11Mit61	2	15	4.167	3.429
D11Mit61	D11Mit167	0	15	0.000	0.000
D11Mit167	D11Mit48	0	7	0.000	0.000
D11Mit48	D11Mit49	0	6	0.000	0.000
D11Mit49	D11Mit104	0	6	0.000	0.000
D11Mit104	D11Nds10	4	19	7.692	4.995
D11Nds10	D11Nds18	4	20	7.143	4.563
D11Nds18	D11Nki1	5	20	10.000	6.197
D11Nki1	Trp53	3	20	4.839	3.323
Trp53	Hba	9	19	40.909	34.175
Hba	Mpmv18	3	19	5.172	3.591
Mpmv18	Egfr	6	20	13.636	8.469
Egfr	Mpmv4	9	20	34.615	26.330
Mpmv4	Mtv3	5	17	13.158	8.847
Mtv3	Es3	2	15	4.167	3.429