Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  17
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46502

Genes

Gene	Assay Type
D17Mit19	PCR amplified length variant
D17Mit18	PCR amplified length variant
D17Mit27	PCR amplified length variant
D17Mit113	PCR amplified length variant
D17Mit46	PCR amplified length variant
D17Mit23	PCR amplified length variant
D17Mit30	PCR amplified length variant
D17Mit16	PCR amplified length variant
D17Nds2	PCR amplified length variant
D17Nds3	PCR amplified length variant
D17Mit13	PCR amplified length variant
D17Mit21	PCR amplified length variant
D17Mit22	PCR amplified length variant
D17Mit34	PCR amplified length variant
D17Mit11	PCR amplified length variant
D17Mit35	PCR amplified length variant
D17Mit51	PCR amplified length variant
D17Mit138	PCR amplified length variant
D17Mit115	PCR amplified length variant
D17Mit10	PCR amplified length variant
D17Mit6	PCR amplified length variant
D17Mit7	PCR amplified length variant
D17Mit20	PCR amplified length variant
D17Mit119	PCR amplified length variant
D17Mit3	PCR amplified length variant
D17Mit92	PCR amplified length variant
D17Mit42	PCR amplified length variant
D17Mit130	PCR amplified length variant
D17Mit1	PCR amplified length variant
D17Nds4	PCR amplified length variant
D17Nds5	PCR amplified length variant
D17Tu34	PCR amplified length variant
Tcp1	PCR amplified length variant
H2-D1	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D17Mit19	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit18	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit27	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	X	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit113	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	.	.	.	.	.	C	C	.	C	.
D17Mit46	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit23	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit30	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	.	C	C	C
D17Mit16	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Nds2	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Nds3	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	X	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit13	.	C	C	C	S	C	C	Z	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit21	.	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit22	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	X	C	X	X	C	X	C	C	C
D17Mit34	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	.
D17Mit11	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit35	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit51	C	C	C	C	S	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	.	C	S	C	C
D17Mit138	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit115	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit10	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Mit6	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit7	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit20	C	C	C	C	C	C	X	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D17Mit119	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	S	C	S	C	S	C	C
D17Mit3	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	S	C	S	C	S	C	C
D17Mit92	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	C	C	.	.	.	.	.	.
D17Mit42	C	C	C	C	C	C	Z	C	S	C	C	C	.	C	C	S	C	S	S	C
D17Mit130	C	C	C	.	C	C	S	C	C	C	C	S	C	C	C	S	C	S	S	C
D17Mit1	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	S	C	C	C	S	C	S	S	C
D17Nds4	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Nds5	C	C	C	Z	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D17Tu34	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
Tcp1	C	C	S	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
H2-D1	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D17Mit19	D17Mit18	0	20	0.000	0.000
D17Mit18	D17Mit27	1	20	1.351	1.424
D17Mit27	D17Mit113	0	13	0.000	0.000
D17Mit113	D17Mit46	1	13	2.174	2.361
D17Mit46	D17Mit23	0	20	0.000	0.000
D17Mit23	D17Mit30	0	18	0.000	0.000
D17Mit30	D17Mit16	0	18	0.000	0.000
D17Mit16	D17Nds2	0	20	0.000	0.000
D17Nds2	D17Nds3	2	20	2.941	2.321
D17Nds3	D17Mit13	3	19	5.172	3.591
D17Mit13	D17Mit21	1	19	1.429	1.510
D17Mit21	D17Mit22	4	19	7.692	4.995
D17Mit22	D17Mit34	4	18	8.333	5.512
D17Mit34	D17Mit11	1	18	1.515	1.606
D17Mit11	D17Mit35	0	20	0.000	0.000
D17Mit35	D17Mit51	0	18	0.000	0.000
D17Mit51	D17Mit138	0	18	0.000	0.000
D17Mit138	D17Mit115	0	20	0.000	0.000
D17Mit115	D17Mit10	0	20	0.000	0.000
D17Mit10	D17Mit6	2	20	2.941	2.321
D17Mit6	D17Mit7	0	20	0.000	0.000
D17Mit7	D17Mit20	1	20	1.351	1.424
D17Mit20	D17Mit119	5	20	10.000	6.197
D17Mit119	D17Mit3	0	20	0.000	0.000
D17Mit3	D17Mit92	3	14	7.895	5.954
D17Mit92	D17Mit42	4	13	14.286	11.037
D17Mit42	D17Mit130	3	18	5.556	3.904
D17Mit130	D17Mit1	0	19	0.000	0.000
D17Mit1	D17Nds4	5	20	10.000	6.197
D17Nds4	D17Nds5	1	20	1.351	1.424
D17Nds5	D17Tu34	3	20	4.839	3.323
D17Tu34	Tcp1	5	20	10.000	6.197
Tcp1	H2-D1	5	20	10.000	6.197