Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  18
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46503

Genes

Gene	Assay Type
D18Mit18	PCR amplified length variant
D18Mit19	PCR amplified length variant
D18Mit31	PCR amplified length variant
D18Mit20	PCR amplified length variant
D18Mit94	PCR amplified length variant
D18Mit83	PCR amplified length variant
D18Mit14	PCR amplified length variant
D18Mit17	PCR amplified length variant
D18Mit35	PCR amplified length variant
D18Mit36	PCR amplified length variant
D18Mit57	PCR amplified length variant
D18Mit58	PCR amplified length variant
D18Mit24	PCR amplified length variant
D18Mit54	PCR amplified length variant
D18Mit28	PCR amplified length variant
D18Mit78	PCR amplified length variant
D18Mit40	PCR amplified length variant
D18Mit51	PCR amplified length variant
D18Mit107	PCR amplified length variant
D18Mit81	PCR amplified length variant
D18Mit100	PCR amplified length variant
D18Mit9	PCR amplified length variant
D18Mit33	PCR amplified length variant
D18Mit103	PCR amplified length variant
D18Mit4	PCR amplified length variant
Mcc	PCR amplified length variant
Dcc	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D18Mit18	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C
D18Mit19	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C
D18Mit31	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	.	C	C	C
D18Mit20	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D18Mit94	C	C	.	C	.	C	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
D18Mit83	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C
D18Mit14	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C
D18Mit17	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	.
D18Mit35	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	S	C	C	C	C
D18Mit36	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	.
D18Mit57	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	X	C	S	C
D18Mit58	C	.	C	C	C	.	C	.	C	C	C	C	C	.	C	S	C	.	S	C
D18Mit24	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	S	C	C	S	C
D18Mit54	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C
D18Mit28	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C
D18Mit78	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C
D18Mit40	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	.
D18Mit51	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	.	C	C	S	C	.	S	S	S	.
D18Mit107	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C
D18Mit81	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C
D18Mit100	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C
D18Mit9	S	C	C	Z	C	C	C	C	C	C	C	Z	C	C	S	S	C	C	Z	C
D18Mit33	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	.	S	C	C	S	C
D18Mit103	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	S	C
D18Mit4	C	C	C	C	Z	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C
Mcc	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C
Dcc	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	S	C

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D18Mit18	D18Mit19	3	19	5.172	3.591
D18Mit19	D18Mit31	3	18	5.556	3.904
D18Mit31	D18Mit20	0	18	0.000	0.000
D18Mit20	D18Mit94	0	5	0.000	0.000
D18Mit94	D18Mit83	0	4	0.000	0.000
D18Mit83	D18Mit14	1	19	1.429	1.510
D18Mit14	D18Mit17	1	18	1.515	1.606
D18Mit17	D18Mit35	1	17	1.613	1.716
D18Mit35	D18Mit36	1	18	1.515	1.606
D18Mit36	D18Mit57	1	19	1.429	1.510
D18Mit57	D18Mit58	1	15	1.852	1.988
D18Mit58	D18Mit24	0	14	0.000	0.000
D18Mit24	D18Mit54	1	19	1.429	1.510
D18Mit54	D18Mit28	1	20	1.351	1.424
D18Mit28	D18Mit78	0	20	0.000	0.000
D18Mit78	D18Mit40	2	19	3.125	2.482
D18Mit40	D18Mit51	7	17	26.923	20.412
D18Mit51	D18Mit107	7	17	26.923	20.412
D18Mit107	D18Mit81	2	20	2.941	2.321
D18Mit81	D18Mit100	0	20	0.000	0.000
D18Mit100	D18Mit9	3	20	4.839	3.323
D18Mit9	D18Mit33	4	18	8.333	5.512
D18Mit33	D18Mit103	0	18	0.000	0.000
D18Mit103	D18Mit4	3	20	4.839	3.323
D18Mit4	Mcc	3	20	4.839	3.323
Mcc	Dcc	2	20	2.941	2.321