Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  1
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46544

Genes

Gene	Assay Type
D1Mit64	PCR amplified length variant
D1Mit1	PCR amplified length variant
D1Mit3	PCR amplified length variant
D1Mit168	PCR amplified length variant
D1Mit4	PCR amplified length variant
D1Mit211	PCR amplified length variant
D1Mit170	PCR amplified length variant
D1Mit171	PCR amplified length variant
D1Mit232	PCR amplified length variant
D1Mit233	PCR amplified length variant
D1Mit234	PCR amplified length variant
D1Mit5.1	PCR amplified length variant
D1Mit21	PCR amplified length variant
D1Mit23	PCR amplified length variant
D1Mit24	PCR amplified length variant
D1Mit180	PCR amplified length variant
D1Mit46	PCR amplified length variant
D1Mit215	PCR amplified length variant
D1Mit8	PCR amplified length variant
D1Mit49	PCR amplified length variant
D1Mit10	PCR amplified length variant
D1Mit11	PCR amplified length variant
D1Mit185	PCR amplified length variant
D1Nds2	PCR amplified length variant
D1Mit28	PCR amplified length variant
D1Mit12	PCR amplified length variant
D1Mit192	PCR amplified length variant
D1Mit30	PCR amplified length variant
D1Mit164	PCR amplified length variant
D1Mit200	PCR amplified length variant
D1Mit43	PCR amplified length variant
D1Mit14	PCR amplified length variant
D1Mit33	PCR amplified length variant
D1Mit227	PCR amplified length variant
D1Mit16	PCR amplified length variant
D1Mit15	PCR amplified length variant
D1Mit36	PCR amplified length variant
D1Mit205	PCR amplified length variant
D1Mit208	PCR amplified length variant
D1Mit220	PCR amplified length variant
D1Mit221	PCR amplified length variant
D1Mit17	PCR amplified length variant
D1Mit155	PCR amplified length variant
Pepc	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D1Mit64	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	.
D1Mit1	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	O	B	.	.
D1Mit3	O	.	B	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	Z	B	O	B	.	.
D1Mit168	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O
D1Mit4	.	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O
D1Mit211	O	O	B	X	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit170	O	O	B	O	O	O	O	O	O	.	.	O	O	O	O	O	B	O	.
D1Mit171	O	.	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit232	O	.	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit233	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit234	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit5.1	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	.	O
D1Mit21	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit23	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit24	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit180	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	O
D1Mit46	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit215	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit8	.	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit49	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit10	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit11	O	O	O	O	.	B	O	O	.	O	O	O	O	O	.	.	O	.	.
D1Mit185	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Nds2	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	.	O	O	.
D1Mit28	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit12	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit192	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit30	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit164	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O
D1Mit200	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	X	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit43	O	O	O	O	O	O	.	O	O	.	B	O	O	O	O	.	.	.	.
D1Mit14	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit33	O	.	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit227	O	O	.	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	.
D1Mit16	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	Z	Z	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit15	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	Z	Z	.	O	O	O	O	O	O
D1Mit36	O	O	O	B	O	B	.	O	O	O	Z	Z	B	O	.	.	.	.	O
D1Mit205	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D1Mit208	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O
D1Mit220	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O
D1Mit221	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	.
D1Mit17	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	Z	B	O	O	O	B	O	B	O
D1Mit155	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	.	B	.
Pepc	O	O	O	Z	O	B	O	O	O	B	.	.	.	.	.	.	O	.	O

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D1Mit64	D1Mit1	3	17	6.000	4.275
D1Mit1	D1Mit3	1	15	1.852	1.988
D1Mit3	D1Mit168	1	15	1.852	1.988
D1Mit168	D1Mit4	0	18	0.000	0.000
D1Mit4	D1Mit211	2	18	3.333	2.667
D1Mit211	D1Mit170	1	16	1.724	1.842
D1Mit170	D1Mit171	0	15	0.000	0.000
D1Mit171	D1Mit232	0	18	0.000	0.000
D1Mit232	D1Mit233	0	18	0.000	0.000
D1Mit233	D1Mit234	0	19	0.000	0.000
D1Mit234	D1Mit5.1	2	18	3.333	2.667
D1Mit5.1	D1Mit21	0	18	0.000	0.000
D1Mit21	D1Mit23	1	19	1.429	1.510
D1Mit23	D1Mit24	0	19	0.000	0.000
D1Mit24	D1Mit180	0	19	0.000	0.000
D1Mit180	D1Mit46	1	19	1.429	1.510
D1Mit46	D1Mit215	0	19	0.000	0.000
D1Mit215	D1Mit8	0	18	0.000	0.000
D1Mit8	D1Mit49	0	18	0.000	0.000
D1Mit49	D1Mit10	1	19	1.429	1.510
D1Mit10	D1Mit11	0	13	0.000	0.000
D1Mit11	D1Mit185	0	13	0.000	0.000
D1Mit185	D1Nds2	1	16	1.724	1.842
D1Nds2	D1Mit28	0	16	0.000	0.000
D1Mit28	D1Mit12	0	19	0.000	0.000
D1Mit12	D1Mit192	0	19	0.000	0.000
D1Mit192	D1Mit30	0	19	0.000	0.000
D1Mit30	D1Mit164	0	18	0.000	0.000
D1Mit164	D1Mit200	1	18	1.515	1.606
D1Mit200	D1Mit43	1	13	2.174	2.361
D1Mit43	D1Mit14	1	12	2.381	2.605
D1Mit14	D1Mit33	2	17	3.571	2.881
D1Mit33	D1Mit227	0	16	0.000	0.000
D1Mit227	D1Mit16	5	17	13.158	8.847
D1Mit16	D1Mit15	0	18	0.000	0.000
D1Mit15	D1Mit36	0	13	0.000	0.000
D1Mit36	D1Mit205	3	14	7.895	5.954
D1Mit205	D1Mit208	4	19	7.692	4.995
D1Mit208	D1Mit220	0	18	0.000	0.000
D1Mit220	D1Mit221	0	16	0.000	0.000
D1Mit221	D1Mit17	2	17	3.571	2.881
D1Mit17	D1Mit155	1	17	1.613	1.716
D1Mit155	Pepc	3	10	13.636	11.976