Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  2
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46545

Genes

Gene	Assay Type
D2Mit4	PCR amplified length variant
D2Mit5	PCR amplified length variant
D2Mit7	PCR amplified length variant
D2Mit156	PCR amplified length variant
D2Mit56	PCR amplified length variant
D2Mit35	PCR amplified length variant
D2Mit128	PCR amplified length variant
D2Mit75	PCR amplified length variant
D2Mit94	PCR amplified length variant
D2Mit160	PCR amplified length variant
D2Mit220	PCR amplified length variant
D2Mit248	PCR amplified length variant
D2Mit331	PCR amplified length variant
D2Mit332	PCR amplified length variant
D2Mit14a	PCR amplified length variant
D2Mit126	PCR amplified length variant
D2Mit127	PCR amplified length variant
D2Nds1	PCR amplified length variant
D2Mit13	PCR amplified length variant
D2Mit42	PCR amplified length variant
D2Mit43	PCR amplified length variant
D2Mit96	PCR amplified length variant
D2Mit97	PCR amplified length variant
D2Mit98	PCR amplified length variant
D2Mit99	PCR amplified length variant
D2Mit100	PCR amplified length variant
D2Mit129	PCR amplified length variant
D2Mit130	PCR amplified length variant
D2Mit184	PCR amplified length variant
D2Mit221	PCR amplified length variant
D2Mit249	PCR amplified length variant
D2Mit250	PCR amplified length variant
D2Mit251	PCR amplified length variant
D2Mit300	PCR amplified length variant
D2Mit301	PCR amplified length variant
D2Mit333	PCR amplified length variant
D2Mit334	PCR amplified length variant
D10Mit1002	PCR amplified length variant
D2Mit58	PCR amplified length variant
D2Mit102	PCR amplified length variant
D2Mit62	PCR amplified length variant
D2Mit63	PCR amplified length variant
D2Mit16a	PCR amplified length variant
D2Mit17	PCR amplified length variant
D2Mit30	PCR amplified length variant
D2Nds3	PCR amplified length variant
D2Mit57	PCR amplified length variant
D2Mit22	PCR amplified length variant
D2Mit55	PCR amplified length variant
D2Mit225	PCR amplified length variant
D2Mit49	PCR amplified length variant
D2Mit227	PCR amplified length variant
D2Mit53	PCR amplified length variant
D2Mit213	PCR amplified length variant
D2Mit200	PCR amplified length variant
D2Mit74	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D2Mit4	O	O	O	B	O	.	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit5	O	O	O	B	.	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit7	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O
D2Mit156	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit56	.	O	.	B	O	.	O	O	B	O	.	.	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit35	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit128	O	O	O	O	B	O	.	.	.	.	O	O	.	O	O	O	.	.	.
D2Mit75	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit94	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit160	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	.
D2Mit220	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	B
D2Mit248	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	B
D2Mit331	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	.	O	.	O	O	.	.	.
D2Mit332	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D2Mit14a	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit126	O	O	O	O	O	O	.	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit127	O	O	O	O	.	O	.	.	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	.
D2Nds1	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit13	.	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit42	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit43	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit96	O	O	O	O	O	.	O	.	O	.	O	O	.	O	.	O	.	O	.
D2Mit97	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit98	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit99	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit100	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	.	.	.	.	O	O	O
D2Mit129	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit130	O	O	.	O	.	O	.	O	.	.	O	O	O	.	O	.	O	.	.
D2Mit184	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B
D2Mit221	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	B
D2Mit249	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O
D2Mit250	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit251	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit300	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D2Mit301	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D2Mit333	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit334	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	B
D10Mit1002	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	B
D2Mit58	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit102	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit62	O	O	O	O	B	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit63	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit16a	O	O	O	.	B	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D2Mit17	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O
D2Mit30	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O
D2Nds3	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit57	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit22	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	.	O	.	O	O	O	O
D2Mit55	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit225	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit49	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit227	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit53	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D2Mit213	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	B	O	.	B	.	.
D2Mit200	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	B	O	B	O	B	O	O	.
D2Mit74	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	B	O	B	O	B	O	O	O

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit4	D2Mit5	0	16	0.000	0.000
D2Mit5	D2Mit7	5	18	11.905	7.756
D2Mit7	D2Mit156	3	19	5.172	3.591
D2Mit156	D2Mit56	0	14	0.000	0.000
D2Mit56	D2Mit35	1	14	2.000	2.159
D2Mit35	D2Mit128	2	11	6.250	5.497
D2Mit128	D2Mit75	1	11	2.632	2.905
D2Mit75	D2Mit94	0	19	0.000	0.000
D2Mit94	D2Mit160	2	18	3.333	2.667
D2Mit160	D2Mit220	1	17	1.613	1.716
D2Mit220	D2Mit248	0	18	0.000	0.000
D2Mit248	D2Mit331	0	13	0.000	0.000
D2Mit331	D2Mit332	0	13	0.000	0.000
D2Mit332	D2Mit14a	0	18	0.000	0.000
D2Mit14a	D2Mit126	0	17	0.000	0.000
D2Mit126	D2Mit127	0	13	0.000	0.000
D2Mit127	D2Nds1	0	14	0.000	0.000
D2Nds1	D2Mit13	2	18	3.333	2.667
D2Mit13	D2Mit42	0	18	0.000	0.000
D2Mit42	D2Mit43	1	19	1.429	1.510
D2Mit43	D2Mit96	0	12	0.000	0.000
D2Mit96	D2Mit97	0	12	0.000	0.000
D2Mit97	D2Mit98	1	18	1.515	1.606
D2Mit98	D2Mit99	2	18	3.333	2.667
D2Mit99	D2Mit100	0	15	0.000	0.000
D2Mit100	D2Mit129	2	15	4.167	3.429
D2Mit129	D2Mit130	0	10	0.000	0.000
D2Mit130	D2Mit184	0	10	0.000	0.000
D2Mit184	D2Mit221	1	18	1.515	1.606
D2Mit221	D2Mit249	2	17	3.571	2.881
D2Mit249	D2Mit250	0	18	0.000	0.000
D2Mit250	D2Mit251	0	19	0.000	0.000
D2Mit251	D2Mit300	0	18	0.000	0.000
D2Mit300	D2Mit301	0	17	0.000	0.000
D2Mit301	D2Mit333	1	17	1.613	1.716
D2Mit333	D2Mit334	2	17	3.571	2.881
D2Mit334	D10Mit1002	4	17	9.091	6.143
D10Mit1002	D2Mit58	6	19	15.000	9.624
D2Mit58	D2Mit102	0	19	0.000	0.000
D2Mit102	D2Mit62	0	18	0.000	0.000
D2Mit62	D2Mit63	0	18	0.000	0.000
D2Mit63	D2Mit16a	0	16	0.000	0.000
D2Mit16a	D2Mit17	0	15	0.000	0.000
D2Mit17	D2Mit30	0	17	0.000	0.000
D2Mit30	D2Nds3	1	18	1.515	1.606
D2Nds3	D2Mit57	1	19	1.429	1.510
D2Mit57	D2Mit22	0	17	0.000	0.000
D2Mit22	D2Mit55	0	17	0.000	0.000
D2Mit55	D2Mit225	0	19	0.000	0.000
D2Mit225	D2Mit49	0	19	0.000	0.000
D2Mit49	D2Mit227	0	19	0.000	0.000
D2Mit227	D2Mit53	1	19	1.429	1.510
D2Mit53	D2Mit213	2	16	3.846	3.131
D2Mit213	D2Mit200	2	16	3.846	3.131
D2Mit200	D2Mit74	0	18	0.000	0.000