Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  3
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46546

Genes

Gene	Assay Type
D3Mit60	PCR amplified length variant
D3Mit1	PCR amplified length variant
D3Mit46	PCR amplified length variant
D3Mit3	PCR amplified length variant
D3Mit5	PCR amplified length variant
D3Mit6	PCR amplified length variant
D3Mit7	PCR amplified length variant
D3Mit25	PCR amplified length variant
D3Mit22	PCR amplified length variant
D3Mit51	PCR amplified length variant
D3Mit9	PCR amplified length variant
D3Mit26	PCR amplified length variant
D3Mit40	PCR amplified length variant
D3Mit49	PCR amplified length variant
D3Mit28	PCR amplified length variant
D3Mit156	PCR amplified length variant
D3Mit11	PCR amplified length variant
D3Mit12	PCR amplified length variant
D3Mit10	PCR amplified length variant
D3Mit39	PCR amplified length variant
D3Mit42	PCR amplified length variant
D3Mit13	PCR amplified length variant
D3Mit159	PCR amplified length variant
D3Mit14	PCR amplified length variant
D3Mit16	PCR amplified length variant
D3Mit125	PCR amplified length variant
D3Mit38	PCR amplified length variant
D3Mit160	PCR amplified length variant
D3Mit17	PCR amplified length variant
D3Mit18	PCR amplified length variant
D3Mit31	PCR amplified length variant
D3Mit32	PCR amplified length variant
D3Mit59	PCR amplified length variant
D3Mit162	PCR amplified length variant
D3Mit163	PCR amplified length variant
D3Mit21	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D3Mit60	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit1	.	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D3Mit46	O	O	.	.	O	B	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	B	O	.
D3Mit3	.	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O
D3Mit5	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O
D3Mit6	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit7	O	O	O	.	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O
D3Mit25	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit22	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit51	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit9	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	.
D3Mit26	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit40	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit49	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit28	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit156	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit11	.	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit12	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	.	O
D3Mit10	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit39	O	O	.	.	O	B	B	O	.	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit42	O	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit13	O	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit159	O	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit14	.	O	O	O	O	Z	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit16	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit125	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit38	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit160	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit17	O	O	O	O	O	Z	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit18	O	O	O	O	O	Z	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	.	O
D3Mit31	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit32	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D3Mit59	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit162	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	.
D3Mit163	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D3Mit21	O	O	O	O	O	.	O	O	O	.	O	O	O	O	.	B	B	O	B

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D3Mit60	D3Mit1	1	18	1.515	1.606
D3Mit1	D3Mit46	0	14	0.000	0.000
D3Mit46	D3Mit3	1	13	2.174	2.361
D3Mit3	D3Mit5	0	17	0.000	0.000
D3Mit5	D3Mit6	0	18	0.000	0.000
D3Mit6	D3Mit7	0	16	0.000	0.000
D3Mit7	D3Mit25	0	16	0.000	0.000
D3Mit25	D3Mit22	0	19	0.000	0.000
D3Mit22	D3Mit51	0	19	0.000	0.000
D3Mit51	D3Mit9	0	17	0.000	0.000
D3Mit9	D3Mit26	0	17	0.000	0.000
D3Mit26	D3Mit40	1	19	1.429	1.510
D3Mit40	D3Mit49	1	19	1.429	1.510
D3Mit49	D3Mit28	1	18	1.515	1.606
D3Mit28	D3Mit156	1	18	1.515	1.606
D3Mit156	D3Mit11	1	18	1.515	1.606
D3Mit11	D3Mit12	0	17	0.000	0.000
D3Mit12	D3Mit10	0	18	0.000	0.000
D3Mit10	D3Mit39	1	16	1.724	1.842
D3Mit39	D3Mit42	0	16	0.000	0.000
D3Mit42	D3Mit13	0	19	0.000	0.000
D3Mit13	D3Mit159	0	19	0.000	0.000
D3Mit159	D3Mit14	2	18	3.333	2.667
D3Mit14	D3Mit16	1	18	1.515	1.606
D3Mit16	D3Mit125	0	19	0.000	0.000
D3Mit125	D3Mit38	0	19	0.000	0.000
D3Mit38	D3Mit160	0	18	0.000	0.000
D3Mit160	D3Mit17	1	18	1.515	1.606
D3Mit17	D3Mit18	0	18	0.000	0.000
D3Mit18	D3Mit31	1	18	1.515	1.606
D3Mit31	D3Mit32	0	19	0.000	0.000
D3Mit32	D3Mit59	1	18	1.515	1.606
D3Mit59	D3Mit162	0	16	0.000	0.000
D3Mit162	D3Mit163	0	17	0.000	0.000
D3Mit163	D3Mit21	3	16	6.522	4.722