Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  5
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46548

Genes

Gene	Assay Type
D5Mit145	PCR amplified length variant
D5Mit179	PCR amplified length variant
D5Mit54	PCR amplified length variant
D5Mit183	PCR amplified length variant
D5Mit184	PCR amplified length variant
D5Mit58	PCR amplified length variant
D5Mit185	PCR amplified length variant
D5Mit112	PCR amplified length variant
D5Mit114	PCR amplified length variant
D5Mit6	PCR amplified length variant
D5Mit7	PCR amplified length variant
D5Mit12	PCR amplified length variant
D5Mit19	PCR amplified length variant
D5Mit10	PCR amplified length variant
D5Mit175	PCR amplified length variant
D5Mit188	PCR amplified length variant
D5Mit27	PCR amplified length variant
D5Mit29	PCR amplified length variant
D5Mit164	PCR amplified length variant
D5Mit31	PCR amplified length variant
D5Mit101	PCR amplified length variant
D5Mit191	PCR amplified length variant
Pgm2	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D5Mit145	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit179	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit54	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit183	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit184	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit58	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit185	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit112	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit114	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit6	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit7	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit12	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit19	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O
D5Mit10	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit175	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit188	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D5Mit27	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O
D5Mit29	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O
D5Mit164	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	.	B	O
D5Mit31	O	O	O	O	O	B	O	O	O	X	X	O	O	B	O	O	O	O	O
D5Mit101	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O
D5Mit191	O	O	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O
Pgm2	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	.	.	.	.	.	.	.	O

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D5Mit145	D5Mit179	0	19	0.000	0.000
D5Mit179	D5Mit54	0	19	0.000	0.000
D5Mit54	D5Mit183	0	19	0.000	0.000
D5Mit183	D5Mit184	1	19	1.429	1.510
D5Mit184	D5Mit58	2	19	3.125	2.482
D5Mit58	D5Mit185	0	18	0.000	0.000
D5Mit185	D5Mit112	1	18	1.515	1.606
D5Mit112	D5Mit114	1	19	1.429	1.510
D5Mit114	D5Mit6	1	19	1.429	1.510
D5Mit6	D5Mit7	0	18	0.000	0.000
D5Mit7	D5Mit12	0	18	0.000	0.000
D5Mit12	D5Mit19	0	18	0.000	0.000
D5Mit19	D5Mit10	1	18	1.515	1.606
D5Mit10	D5Mit175	0	19	0.000	0.000
D5Mit175	D5Mit188	0	19	0.000	0.000
D5Mit188	D5Mit27	4	19	7.692	4.995
D5Mit27	D5Mit29	0	19	0.000	0.000
D5Mit29	D5Mit164	1	18	1.515	1.606
D5Mit164	D5Mit31	3	18	5.556	3.904
D5Mit31	D5Mit101	2	19	3.125	2.482
D5Mit101	D5Mit191	0	19	0.000	0.000
D5Mit191	Pgm2	2	11	6.250	5.497