Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  9
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46552

Genes

Gene	Assay Type
D9Mit42	PCR amplified length variant
D9Mit90	PCR amplified length variant
D9Mit2	PCR amplified length variant
D9Mit45	PCR amplified length variant
D9Mit154	PCR amplified length variant
D9Mit4	PCR amplified length variant
D9Mit27	PCR amplified length variant
D9Mit6	PCR amplified length variant
D9Mit31	PCR amplified length variant
D9Mit32	PCR amplified length variant
D9Mit165	PCR amplified length variant
D9Mit54	PCR amplified length variant
D9Mit8	PCR amplified length variant
D9Nds2	PCR amplified length variant
D9Mit9	PCR amplified length variant
D9Mit11	PCR amplified length variant
D9Mit10	PCR amplified length variant
D9Mit35	PCR amplified length variant
D9Mit12	PCR amplified length variant
D9Mit36	PCR amplified length variant
D9Mit24	PCR amplified length variant
D9Mit15	PCR amplified length variant
D9Mit16	PCR amplified length variant
D9Mit37a	PCR amplified length variant
D9Mit38	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D9Mit42	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	.	O	O
D9Mit90	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	B	O	B	O	O
D9Mit2	O	O	O	B	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	B	O	B	O	O
D9Mit45	O	.	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	.	O	O	O	B
D9Mit154	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit4	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	.	B
D9Mit27	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit6	.	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	O	.	.
D9Mit31	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit32	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit165	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit54	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B
D9Mit8	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	B
D9Nds2	Z	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	.	.
D9Mit9	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	B
D9Mit11	O	O	O	B	O	.	O	O	O	O	O	.	B	B	O	O	O	O	B
D9Mit10	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	.	O	Z
D9Mit35	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	.	O	B
D9Mit12	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	.	B	B	O	O	O	O	B
D9Mit36	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	B
D9Mit24	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	B
D9Mit15	B	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	B	B
D9Mit16	B	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	O	Z	O	.	B	B
D9Mit37a	B	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	B	B
D9Mit38	B	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	B	B

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D9Mit42	D9Mit90	2	18	3.333	2.667
D9Mit90	D9Mit2	0	19	0.000	0.000
D9Mit2	D9Mit45	3	17	6.000	4.275
D9Mit45	D9Mit154	0	17	0.000	0.000
D9Mit154	D9Mit4	0	18	0.000	0.000
D9Mit4	D9Mit27	2	18	3.333	2.667
D9Mit27	D9Mit6	4	16	10.000	6.928
D9Mit6	D9Mit31	4	16	10.000	6.928
D9Mit31	D9Mit32	2	19	3.125	2.482
D9Mit32	D9Mit165	2	19	3.125	2.482
D9Mit165	D9Mit54	0	19	0.000	0.000
D9Mit54	D9Mit8	2	19	3.125	2.482
D9Mit8	D9Nds2	1	17	1.613	1.716
D9Nds2	D9Mit9	1	17	1.613	1.716
D9Mit9	D9Mit11	0	17	0.000	0.000
D9Mit11	D9Mit10	1	16	1.724	1.842
D9Mit10	D9Mit35	1	18	1.515	1.606
D9Mit35	D9Mit12	0	16	0.000	0.000
D9Mit12	D9Mit36	0	17	0.000	0.000
D9Mit36	D9Mit24	1	19	1.429	1.510
D9Mit24	D9Mit15	4	19	7.692	4.995
D9Mit15	D9Mit16	1	18	1.515	1.606
D9Mit16	D9Mit37a	1	18	1.515	1.606
D9Mit37a	D9Mit38	0	19	0.000	0.000