Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  12
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46555

Genes

Gene	Assay Type
D7Mit1000	PCR amplified length variant
D12Mit1	PCR amplified length variant
D12Mit82	PCR amplified length variant
D12Mit83	PCR amplified length variant
D12Mit136	PCR amplified length variant
D12Mit127	PCR amplified length variant
D12Mit54	PCR amplified length variant
D12Mit31	PCR amplified length variant
D12Mit88	PCR amplified length variant
D12Mit36	PCR amplified length variant
D12Mit33	PCR amplified length variant
D12Mit34	PCR amplified length variant
D12Mit52	PCR amplified length variant
D12Mit116	PCR amplified length variant
D12Mit14	PCR amplified length variant
D12Mit95	PCR amplified length variant
D12Mit51	PCR amplified length variant
D12Mit6	PCR amplified length variant
D12Mit98	PCR amplified length variant
D12Mit7	PCR amplified length variant
D12Mit27	PCR amplified length variant
D12Mit17	PCR amplified length variant
D12Mit8	PCR amplified length variant
D12Mit20	PCR amplified length variant
D12Mit144	PCR amplified length variant
D12Nds2	PCR amplified length variant
D12Nds4	PCR amplified length variant
D12Nds11	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D7Mit1000	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D12Mit1	O	B	Z	O	O	.	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit82	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit83	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	.
D12Mit136	O	B	X	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit127	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit54	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	.	.	O	O	O	O
D12Mit31	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit88	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit36	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit33	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit34	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	Z	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit52	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit116	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit14	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D12Mit95	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O
D12Mit51	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit6	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit98	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Mit7	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	Z	O
D12Mit27	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Mit17	B	B	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D12Mit8	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Mit20	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Mit144	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Nds2	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Nds4	O	B	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D12Nds11	O	B	.	O	O	O	O	.	O	.	O	.	.	.	.	.	.	.	.

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D7Mit1000	D12Mit1	4	17	9.091	6.143
D12Mit1	D12Mit82	1	18	1.515	1.606
D12Mit82	D12Mit83	1	18	1.515	1.606
D12Mit83	D12Mit136	1	18	1.515	1.606
D12Mit136	D12Mit127	2	18	3.333	2.667
D12Mit127	D12Mit54	0	16	0.000	0.000
D12Mit54	D12Mit31	0	16	0.000	0.000
D12Mit31	D12Mit88	0	18	0.000	0.000
D12Mit88	D12Mit36	0	18	0.000	0.000
D12Mit36	D12Mit33	1	18	1.515	1.606
D12Mit33	D12Mit34	1	19	1.429	1.510
D12Mit34	D12Mit52	1	19	1.429	1.510
D12Mit52	D12Mit116	0	19	0.000	0.000
D12Mit116	D12Mit14	0	18	0.000	0.000
D12Mit14	D12Mit95	0	17	0.000	0.000
D12Mit95	D12Mit51	0	18	0.000	0.000
D12Mit51	D12Mit6	0	19	0.000	0.000
D12Mit6	D12Mit98	1	19	1.429	1.510
D12Mit98	D12Mit7	1	18	1.515	1.606
D12Mit7	D12Mit27	1	18	1.515	1.606
D12Mit27	D12Mit17	3	18	5.556	3.904
D12Mit17	D12Mit8	2	18	3.333	2.667
D12Mit8	D12Mit20	0	19	0.000	0.000
D12Mit20	D12Mit144	2	19	3.125	2.482
D12Mit144	D12Nds2	2	19	3.125	2.482
D12Nds2	D12Nds4	0	19	0.000	0.000
D12Nds4	D12Nds11	1	8	3.846	4.428