Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  15
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46558

Genes

Gene	Assay Type
D15Mit12	PCR amplified length variant
D15Mit13	PCR amplified length variant
D15Nds2	PCR amplified length variant
D15Mit6	PCR amplified length variant
D15Mit5	PCR amplified length variant
D15Mit24	PCR amplified length variant
D15Mit17	PCR amplified length variant
D15Mit27	PCR amplified length variant
D15Nds1	PCR amplified length variant
D15Mit29	PCR amplified length variant
D15Mit96	PCR amplified length variant
D15Mit108	PCR amplified length variant
D15Mit39	PCR amplified length variant
D15Mit41	PCR amplified length variant
D15Mit42	PCR amplified length variant
D15Mit44	PCR amplified length variant
D15Mit43	PCR amplified length variant
D15Mit78	PCR amplified length variant
D15Mit14	PCR amplified length variant
D15Mit15	PCR amplified length variant
D15Mit35	PCR amplified length variant
D15Mit79	PCR amplified length variant
D15Mit40	PCR amplified length variant
D15Nds3	PCR amplified length variant
D15Nds5	PCR amplified length variant
D15Nds6	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D15Mit12	O	O	O	B	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D15Mit13	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D15Nds2	.	O	O	B	O	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	B	B	O	O
D15Mit6	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D15Mit5	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D15Mit24	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D15Mit17	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D15Mit27	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D15Nds1	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	.	.
D15Mit29	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O
D15Mit96	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	O	O
D15Mit108	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.
D15Mit39	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Mit41	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Mit42	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	.	O	O	B	O	.	.	O
D15Mit44	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Mit43	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.
D15Mit78	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Mit14	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	.	O	B	O	O	O	O
D15Mit15	O	O	O	.	O	O	O	B	O	O	O	O	O	.	B	O	O	O	.
D15Mit35	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.
D15Mit79	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Mit40	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Nds3	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	.	O	O
D15Nds5	O	O	O	O	O	O	.	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O
D15Nds6	.	O	.	O	.	O	O	B	.	O	O	O	O	O	B	O	O	.	O

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D15Mit12	D15Mit13	0	18	0.000	0.000
D15Mit13	D15Nds2	1	17	1.613	1.716
D15Nds2	D15Mit6	2	16	3.846	3.131
D15Mit6	D15Mit5	0	18	0.000	0.000
D15Mit5	D15Mit24	0	18	0.000	0.000
D15Mit24	D15Mit17	2	18	3.333	2.667
D15Mit17	D15Mit27	2	19	3.125	2.482
D15Mit27	D15Nds1	3	17	6.000	4.275
D15Nds1	D15Mit29	1	17	1.613	1.716
D15Mit29	D15Mit96	2	19	3.125	2.482
D15Mit96	D15Mit108	4	18	8.333	5.512
D15Mit108	D15Mit39	0	18	0.000	0.000
D15Mit39	D15Mit41	0	19	0.000	0.000
D15Mit41	D15Mit42	0	16	0.000	0.000
D15Mit42	D15Mit44	1	16	1.724	1.842
D15Mit44	D15Mit43	1	18	1.515	1.606
D15Mit43	D15Mit78	1	18	1.515	1.606
D15Mit78	D15Mit14	0	18	0.000	0.000
D15Mit14	D15Mit15	0	15	0.000	0.000
D15Mit15	D15Mit35	0	16	0.000	0.000
D15Mit35	D15Mit79	0	18	0.000	0.000
D15Mit79	D15Mit40	0	19	0.000	0.000
D15Mit40	D15Nds3	4	17	9.091	6.143
D15Nds3	D15Nds5	4	16	10.000	6.928
D15Nds5	D15Nds6	0	13	0.000	0.000