Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  16
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46559

Genes

Gene	Assay Type
D16Mit79	PCR amplified length variant
D16Mit130	PCR amplified length variant
D16Mit54	PCR amplified length variant
D16Mit9	PCR amplified length variant
D16Mit108	PCR amplified length variant
D16Mit131	PCR amplified length variant
D16Mit101	PCR amplified length variant
D16Mit102	PCR amplified length variant
D16Mit103	PCR amplified length variant
D16Mit36	PCR amplified length variant
D16Mit4	PCR amplified length variant
D16Mit12	PCR amplified length variant
D16Mit15	PCR amplified length variant
D16Mit14	PCR amplified length variant
D16Mit46	PCR amplified length variant
D16Mit5	PCR amplified length variant
D16Mit19	PCR amplified length variant
D16Mit71	PCR amplified length variant
D16Mit132	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D16Mit79	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit130	O	B	O	O	O	B	O	.	B	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O
D16Mit54	O	B	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit9	O	B	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit108	O	B	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	.	O	O	O	O	X
D16Mit131	O	B	O	O	O	B	O	O	B	O	.	O	.	.	.	.	O	O	.
D16Mit101	O	B	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.
D16Mit102	O	B	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit103	O	O	O	O	O	B	B	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O	O
D16Mit36	O	O	O	O	X	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit4	O	Z	O	O	O	.	B	O	O	X	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit12	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit15	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	.	.
D16Mit14	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	X	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit46	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B
D16Mit5	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	.	O
D16Mit19	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D16Mit71	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D16Mit132	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D16Mit79	D16Mit130	1	17	1.613	1.716
D16Mit130	D16Mit54	0	17	0.000	0.000
D16Mit54	D16Mit9	0	19	0.000	0.000
D16Mit9	D16Mit108	1	18	1.515	1.606
D16Mit108	D16Mit131	0	13	0.000	0.000
D16Mit131	D16Mit101	2	13	5.000	4.228
D16Mit101	D16Mit102	0	18	0.000	0.000
D16Mit102	D16Mit103	1	18	1.515	1.606
D16Mit103	D16Mit36	1	18	1.515	1.606
D16Mit36	D16Mit4	3	18	5.556	3.904
D16Mit4	D16Mit12	3	18	5.556	3.904
D16Mit12	D16Mit15	1	17	1.613	1.716
D16Mit15	D16Mit14	2	17	3.571	2.881
D16Mit14	D16Mit46	3	19	5.172	3.591
D16Mit46	D16Mit5	1	18	1.515	1.606
D16Mit5	D16Mit19	2	18	3.333	2.667
D16Mit19	D16Mit71	1	19	1.429	1.510
D16Mit71	D16Mit132	2	19	3.125	2.482