Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  19
• Reference
  J:20807 Keller SA, et al., Kidney and retinal defects (Krd), a transgene-induced mutation with a deletion of mouse chromosome 19 that includes the Pax2 locus. Genomics. 1994 Sep 15;23(2):309-20
• ID
  MGI:47049

Genes

Gene	Assay Type	Description
D19Mit20	PCR amplified length variant
D19Mit11.1	PCR amplified length variant
Pax2	Southern analysis	c31A, cPX
D19Mit24	PCR amplified length variant
D19Mit27	PCR amplified length variant
D19Umi1	PCR amplified length variant	D19Umi1-pA, D19Umi1-pC
Cyp17a1	Southern analysis	Cyp17[a]
D19Mit17	PCR amplified length variant
D19Mit1	PCR amplified length variant
Adrb1	Southern analysis	[b]-1

Notes

• Reference
  Authors use Scd-1, Adrb-1 and Cyp2c for locus symbols Scd1, Adrb1 and Cyp2c29 respectively.

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
• Strain
  (C57BL/6-Tg(AMY1C)9257Mm or C57BL/6J-Tg.283 x SPRET/Ei)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  C57BL/6J
• Allele 1
  b from C57BL/6J
• Allele 2
  s from SPRET/EiJ

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D19Mit20	D19Mit11.1	1	169
D19Mit11.1	Pax2	8	162
D19Mit11.1	D19Mit24	8	162
D19Mit11.1	D19Mit27	8	162
Pax2	D19Umi1	3	170
Pax2	Cyp17a1	3	170
Pax2	D19Mit17	3	170
D19Mit24	D19Umi1	3	170
D19Mit24	Cyp17a1	3	170
D19Mit24	D19Mit17	3	170
D19Mit27	D19Umi1	3	170
D19Mit27	Cyp17a1	3	170
D19Mit27	D19Mit17	3	170
D19Umi1	D19Mit1	2	41
Cyp17a1	D19Mit1	2	41
D19Mit17	D19Mit1	2	41
D19Mit1	Adrb1	1	42

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D19Mit20	D19Mit11.1	1	170	0.588	0.587
D19Mit11.1	Pax2	8	170	4.706	1.624
D19Mit11.1	D19Mit24	8	170	4.706	1.624
D19Mit11.1	D19Mit27	8	170	4.706	1.624
Pax2	D19Umi1	3	173	1.734	0.992
Pax2	Cyp17a1	3	173	1.734	0.992
Pax2	D19Mit17	3	173	1.734	0.992
D19Mit24	D19Umi1	3	173	1.734	0.992
D19Mit24	Cyp17a1	3	173	1.734	0.992
D19Mit24	D19Mit17	3	173	1.734	0.992
D19Mit27	D19Umi1	3	173	1.734	0.992
D19Mit27	Cyp17a1	3	173	1.734	0.992
D19Mit27	D19Mit17	3	173	1.734	0.992
D19Umi1	D19Mit1	2	43	4.651	3.211
Cyp17a1	D19Mit1	2	43	4.651	3.211
D19Mit17	D19Mit1	2	43	4.651	3.211
D19Mit1	Adrb1	1	43	2.326	2.298