Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:35172 Vogt TF, et al., Polydactyly in the Strong's luxoid mouse is suppressed by limb deformity alleles. Dev Genet. 1996;19(1):33-42
• ID
  MGI:47226

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit1	PCR amplified length variant
Hoxd9	PCR amplified length variant	Hoxd9-pA, Hoxd9-pB
D2Mit14a	PCR amplified length variant
D2Mit75	PCR amplified length variant
D2Mit126	PCR amplified length variant
D2Mit130	PCR amplified length variant
Alx4	visible phenotype
D2Nds1	reported elsewhere
D2Mit13	PCR amplified length variant
D2Mit42	PCR amplified length variant
D2Mit43	PCR amplified length variant
D2Mit99	PCR amplified length variant
Fmn1	PCR amplified length variant	Fmn-pA, FmnpB
D2Mit62	PCR amplified length variant
a	visible phenotype

Notes

• Reference
  Authors use ld for locus symbol Fmn.
• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, male
• Female Parent
  <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l>/<l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l>
• Strain
  LSTDP/Fo- + + a/+ + a
• Male Parent
  <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l> <l>/<a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a> <a>
• Strain
  (LSTDP/Fo- + + a/+ + a x + Fmn1 A/+ + A STOCK)F1
• Allele 1
  l from LSTDP/Fo
• Allele 2
  a from STOCK Fmn1

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit1	Hoxd9	4	159
Hoxd9	D2Mit14a	7	156
Hoxd9	D2Mit75	7	156
Hoxd9	D2Mit126	7	156
D2Mit14a	D2Mit130	2	161
D2Mit14a	Alx4	2	161
D2Mit75	D2Mit130	2	161
D2Mit75	Alx4	2	161
D2Mit126	D2Mit130	2	161
D2Mit126	Alx4	2	161
D2Mit130	D2Nds1	1	162
Alx4	D2Nds1	1	162
D2Nds1	D2Mit13	5	158
D2Nds1	D2Mit42	5	158
D2Nds1	D2Mit43	5	158
D2Nds1	D2Mit99	5	158
D2Mit13	Fmn1	3	160
D2Mit13	D2Mit62	3	160
D2Mit42	Fmn1	3	160
D2Mit42	D2Mit62	3	160
D2Mit43	Fmn1	3	160
D2Mit43	D2Mit62	3	160
D2Mit99	Fmn1	3	160
D2Mit99	D2Mit62	3	160
Fmn1	a	20	125
D2Mit62	a	20	125
D2Mit130	Alx4	0	163

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit1	Hoxd9	4	163	2.454	1.212
Hoxd9	D2Mit14a	7	163	4.294	1.588
Hoxd9	D2Mit75	7	163	4.294	1.588
Hoxd9	D2Mit126	7	163	4.294	1.588
D2Mit14a	D2Mit130	2	163	1.227	0.862
D2Mit14a	Alx4	2	163	1.227	0.862
D2Mit75	D2Mit130	2	163	1.227	0.862
D2Mit75	Alx4	2	163	1.227	0.862
D2Mit126	D2Mit130	2	163	1.227	0.862
D2Mit126	Alx4	2	163	1.227	0.862
D2Mit130	D2Nds1	1	163	0.613	0.612
Alx4	D2Nds1	1	163	0.613	0.612
D2Nds1	D2Mit13	5	163	3.067	1.351
D2Nds1	D2Mit42	5	163	3.067	1.351
D2Nds1	D2Mit43	5	163	3.067	1.351
D2Nds1	D2Mit99	5	163	3.067	1.351
D2Mit13	Fmn1	3	163	1.840	1.053
D2Mit13	D2Mit62	3	163	1.840	1.053
D2Mit42	Fmn1	3	163	1.840	1.053
D2Mit42	D2Mit62	3	163	1.840	1.053
D2Mit43	Fmn1	3	163	1.840	1.053
D2Mit43	D2Mit62	3	163	1.840	1.053
D2Mit99	Fmn1	3	163	1.840	1.053
D2Mit99	D2Mit62	3	163	1.840	1.053
Fmn1	a	20	145	13.793	2.864
D2Mit62	a	20	145	13.793	2.864
D2Mit130	Alx4	0	163	0.000	0.000