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Mapping Data
Experiment
  • Experiment
    CROSS
  • Chromosome
    16
  • Reference
    J:36447 Wei J, et al., Linkage mapping of microdissected clones from distal mouse chromosome 16. Somat Cell Mol Genet. 1996 May;22(3):227-32
  • ID
    MGI:47778
Genes
GeneAlleleAssay TypeDescription
D16Ium44 PCR amplified length variant D16Ium44-pA, D16Ium44-pB
D16Ium68 PCR amplified length variant D16Ium68-pA, D16Ium68-pB
D16Ium69 PCR amplified length variant D16Ium69-pA, D16Ium69-pB
D16Ium73 PCR amplified length variant D16Ium73-pA, D16Ium73-pB
D16Ium43 PCR amplified length variant D16Ium43-pA, D16Ium43-pB
D16Ium61 PCR amplified length variant D16Ium61-pA, D16Ium61-pB
D16Ium46 PCR amplified length variant D16Ium46-pA, D16Ium46-pB
D16Ium56 PCR amplified length variant D16Ium56-pA, D16Ium56-pB
D16Mit5 reported elsewhere
D16Ium77 PCR amplified length variant D16Ium77-pA, D16Ium77-pB
D16Ium59 PCR amplified length variant D16Ium59-pA, D16Ium59-pB
D16Ium60 PCR amplified length variant D16Ium60-pA, D16Ium60-pB
D16Ium64 PCR amplified length variant D16Ium64-pA, D16Ium64-pB
D16Ium66 PCR amplified length variant D16Ium66-pA, D16Ium66-pB
D16Ium67 PCR amplified length variant D16Ium67-pA, D16Ium67-pB
D16Ium74 PCR amplified length variant D16Ium74-pA, D16Ium74-pB
D16Ium45 PCR amplified length variant D16Ium45-pA, D16Ium45-pB
D16Ium50 PCR amplified length variant D16Ium50-pA, D16Ium50-pB
D16Ium55 PCR amplified length variant D16Ium55-pA, D16Ium55-pB
D16Ium63 PCR amplified length variant D16Ium63-pA, D16Ium63-pB
D16Ium65 PCR amplified length variant D16Ium65-pA, D16Ium65-pB
D16Bir10 reported elsewhere
D16Ium40 PCR amplified length variant D16Ium40-pA, D16Ium40-pB
D16Ium53 PCR amplified length variant D16Ium53-pA, D16Ium53-pB
D16Ium54 PCR amplified length variant D16Ium54-pA, D16Ium54-pB
D16Ium58 PCR amplified length variant D16Ium58-pA, D16Ium58-pB
D16Ium76 PCR amplified length variant D16Ium76-pA, D16Ium76-pB
D16Ium42 PCR amplified length variant D16Ium42-pA, D16Ium42-pB
D16Ium47 PCR amplified length variant D16Ium47-pA, D16Ium47-pB
D16Ium57 PCR amplified length variant D16Ium57-pA, D16Ium57-pB
D16Mit141 PCR amplified length variant D16Mit141-pA, D16Mit141-pB
D16Ium48 PCR amplified length variant D16Ium48-pA, D16Ium48-pB
D16Ium49 PCR amplified length variant D16Ium49-pA, D16Ium49-pB
D16Ium62 PCR amplified length variant D16Ium62-pA, D16Ium62-pB
D16Ium70 PCR amplified length variant D16Ium70-pA, D16Ium70-pB
Gabpa reported elsewhere
D16Ium71 PCR amplified length variant D16Ium71-pA, D16Ium71-pB
D16Mit117 PCR amplified length variant D16Mit117-pA, D16Mit117-pA
D16Ium72 PCR amplified length variant D16Ium72-pA, D16Ium72-pB
D16Ium41 PCR amplified length variant D16Ium41-pA, D16Ium41-pB
D16Mit94 reported elsewhere
D16Mit6 reported elsewhere
D16Ium52 PCR amplified length variant D16Ium52-pA, D16Ium52-pB
Pcp4 PCR amplified length variant Pcp4-pA, Pcp4-pB
D16Mit119 PCR amplified length variant D16Mit119-pA, D16Mit119-pB
Mx1 PCR amplified length variant Mx1-pA, Mx1-pB
Ets2 PCR amplified length variant Ets2-pA, Ets2-pB
D16Mit20 PCR amplified length variant D16Mit20-pA, D16Mit20-pB
D16Ium51 PCR amplified length variant D16Ium51-pA, D16Ium-pB
D16Ium75 PCR amplified length variant D16Ium75-pA, D16Ium75-pB
D16Mit71 PCR amplified length variant D16Mit71-pA, D16Mit71-pB
Notes
  • Experiment
    Detailed mapping data for markers segregating in this cross is associated with the JAX (BSS) mapping panel, accessible by clicking on the JAX link highlighted below.Offspring types indicate alleles inherited from F1 parent.
    F1 direction known.
CROSS
  • Type
    Backcross, female
  • Female Parent
    <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
  • Strain
    (C57BL/6JEi x SPRET/Ei)F1
  • Male Parent
    <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
  • Strain
    SPRET/EiJ
  • Mapping Panel
  • Allele 1
    b from C57BL/6JEiJ
  • Allele 2
    s from SPRET/EiJ
CROSS Data
MC #mice D16Ium44 D16Ium68 D16Ium69 D16Ium73 D16Ium43 D16Ium61 D16Ium46 D16Ium56 D16Mit5 D16Ium77 D16Ium59 D16Ium60 D16Ium64 D16Ium66 D16Ium67 D16Ium74 D16Ium45 D16Ium50 D16Ium55 D16Ium63 D16Ium65 D16Bir10 D16Ium40 D16Ium53 D16Ium54 D16Ium58 D16Ium76 D16Ium42 D16Ium47 D16Ium57 D16Mit141 D16Ium48 D16Ium49 D16Ium62 D16Ium70 Gabpa D16Ium71 D16Mit117 D16Ium72 D16Ium41 D16Mit94 D16Mit6 D16Ium52 Pcp4 D16Mit119 Mx1 Ets2 D16Mit20 D16Ium51 D16Ium75 D16Mit71
1 s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s b b b b b b b
Statistics
Marker 1 Marker 2 # Recombinants Total % Recombinants Std Error
D16Ium44 D16Ium68 0 1 0.000 0.000
D16Ium68 D16Ium69 0 1 0.000 0.000
D16Ium69 D16Ium73 0 1 0.000 0.000
D16Ium73 D16Ium43 0 1 0.000 0.000
D16Ium43 D16Ium61 0 1 0.000 0.000
D16Ium61 D16Ium46 0 1 0.000 0.000
D16Ium46 D16Ium56 0 1 0.000 0.000
D16Ium56 D16Mit5 0 1 0.000 0.000
D16Mit5 D16Ium77 0 1 0.000 0.000
D16Ium77 D16Ium59 0 1 0.000 0.000
D16Ium59 D16Ium60 0 1 0.000 0.000
D16Ium60 D16Ium64 0 1 0.000 0.000
D16Ium64 D16Ium66 0 1 0.000 0.000
D16Ium66 D16Ium67 0 1 0.000 0.000
D16Ium67 D16Ium74 0 1 0.000 0.000
D16Ium74 D16Ium45 0 1 0.000 0.000
D16Ium45 D16Ium50 0 1 0.000 0.000
D16Ium50 D16Ium55 0 1 0.000 0.000
D16Ium55 D16Ium63 0 1 0.000 0.000
D16Ium63 D16Ium65 0 1 0.000 0.000
D16Ium65 D16Bir10 0 1 0.000 0.000
D16Bir10 D16Ium40 0 1 0.000 0.000
D16Ium40 D16Ium53 0 1 0.000 0.000
D16Ium53 D16Ium54 0 1 0.000 0.000
D16Ium54 D16Ium58 0 1 0.000 0.000
D16Ium58 D16Ium76 0 1 0.000 0.000
D16Ium76 D16Ium42 0 1 0.000 0.000
D16Ium42 D16Ium47 0 1 0.000 0.000
D16Ium47 D16Ium57 0 1 0.000 0.000
D16Ium57 D16Mit141 0 1 0.000 0.000
D16Mit141 D16Ium48 0 1 0.000 0.000
D16Ium48 D16Ium49 0 1 0.000 0.000
D16Ium49 D16Ium62 0 1 0.000 0.000
D16Ium62 D16Ium70 0 1 0.000 0.000
D16Ium70 Gabpa 0 1 0.000 0.000
Gabpa D16Ium71 0 1 0.000 0.000
D16Ium71 D16Mit117 0 1 0.000 0.000
D16Mit117 D16Ium72 0 1 0.000 0.000
D16Ium72 D16Ium41 0 1 0.000 0.000
D16Ium41 D16Mit94 0 1 0.000 0.000
D16Mit94 D16Mit6 0 1 0.000 0.000
D16Mit6 D16Ium52 0 1 0.000 0.000
D16Ium52 Pcp4 0 1 0.000 0.000
Pcp4 D16Mit119 1 1 100.000 0.000
D16Mit119 Mx1 0 1 0.000 0.000
Mx1 Ets2 0 1 0.000 0.000
Ets2 D16Mit20 0 1 0.000 0.000
D16Mit20 D16Ium51 0 1 0.000 0.000
D16Ium51 D16Ium75 0 1 0.000 0.000
D16Ium75 D16Mit71 0 1 0.000 0.000

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO)
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