Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:37225 Peichel CL, et al., Genetic and physical mapping of the mouse Ulnaless locus. Genetics. 1996 Dec;144(4):1757-67
• ID
  MGI:48127

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit11	SSLP
D2Mit92	SSLP
D2Mit328	SSLP
Dlx2	SSCP	D2Tfv3F/D2Tfv3R
Hoxd11	SSLP	D2Tfv9F/D2Tfv9R
Hoxd	visible phenotype
D2Mit93	SSLP
D2Mit183	SSLP
D2Mit159	SSLP
D2Mit75	SSLP
D2Mit248	SSLP
D2Mit14a	SSLP
Mdk	SSCP	TV110/TV111
D2Mit15	SSLP

Notes

• Reference
  Authors state that all ten genes of the Hoxd cluster are possible candidate genes for U1.
• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  (B6C3F1-Lnpk

  /+ x FVB/N)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  FVB/N
• Allele 1
  c from B6C3F1-Lnpk
• Allele 2
  b from FVB/N

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit11	D2Mit92	1	87
D2Mit92	D2Mit328	1	512
D2Mit92	Dlx2	1	512
D2Mit328	Hoxd11	5	508
Dlx2	Hoxd11	5	508
D2Mit328	Hoxd	5	508
Dlx2	Hoxd	5	508
Hoxd11	D2Mit93	5	508
Hoxd	D2Mit93	5	508
D2Mit93	D2Mit183	3	510
D2Mit93	D2Mit159	3	510
D2Mit183	D2Mit75	7	506
D2Mit159	D2Mit75	7	506
D2Mit75	D2Mit248	2	511
D2Mit248	D2Mit14a	2	511
D2Mit14a	Mdk	5	508
Mdk	D2Mit15	1	512

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit11	D2Mit92	1	88	1.136	1.130
D2Mit92	D2Mit328	1	513	0.195	0.195
D2Mit92	Dlx2	1	513	0.195	0.195
D2Mit328	Hoxd11	5	513	0.975	0.434
Dlx2	Hoxd11	5	513	0.975	0.434
D2Mit328	Hoxd	5	513	0.975	0.434
Dlx2	Hoxd	5	513	0.975	0.434
Hoxd11	D2Mit93	5	513	0.975	0.434
Hoxd	D2Mit93	5	513	0.975	0.434
D2Mit93	D2Mit183	3	513	0.585	0.337
D2Mit93	D2Mit159	3	513	0.585	0.337
D2Mit183	D2Mit75	7	513	1.365	0.512
D2Mit159	D2Mit75	7	513	1.365	0.512
D2Mit75	D2Mit248	2	513	0.390	0.275
D2Mit248	D2Mit14a	2	513	0.390	0.275
D2Mit14a	Mdk	5	513	0.975	0.434
Mdk	D2Mit15	1	513	0.195	0.195