Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:37225 Peichel CL, et al., Genetic and physical mapping of the mouse Ulnaless locus. Genetics. 1996 Dec;144(4):1757-67
• ID
  MGI:48128

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit11	SSLP
D2Mit381	SSLP
D2Mit328	SSLP
D2Mit245	SSLP
D2Mit10	SSLP
D2Hun5	SSLP
D2Pri1	Southern analysis	FF1L
Hoxd11	SSLP	D2Tfv9F/D2TTFfv9R
Hoxd1	SSCP	D2Tfv13F/D2TTFfv13R, D2Tfv14F/D2TTFfv14R
Hoxd	visible phenotype
D2Mit247	SSLP
D2Mit418	SSLP
D2Mit219	SSLP
D2Mit435	SSLP
D2Mit93	SSLP
D2Mit183	SSLP
D2Mit246	SSLP
D2Mit299	SSLP
D2Mit159	SSLP
D2Mit160	SSLP
D2Mit248	SSLP
D2Mit128	SSLP
D2Mit14a	SSLP
Mdk	SSCP	TV110/TV111

Notes

• Reference
  Authors state that all ten genes of the Hoxd cluster are possible candidate genes for U1.
• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  (B6C3F1-Lnpk

  /+ x CAST/Ei)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  C57BL/6J
• Allele 1
  b from C57BL/6J
• Allele 2
  c from CAST/EiJ

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit11	D2Mit10	5	339
D2Mit381	D2Mit10	5	339
D2Mit328	D2Mit10	5	339
D2Mit245	D2Mit10	5	339
D2Mit11	D2Hun5	5	339
D2Mit381	D2Hun5	5	339
D2Mit328	D2Hun5	5	339
D2Mit245	D2Hun5	5	339
D2Mit10	D2Pri1	1	343
D2Mit10	Hoxd11	1	343
D2Mit10	Hoxd1	1	343
D2Mit10	Hoxd	1	343
D2Mit10	D2Mit247	1	343
D2Mit10	D2Mit418	1	343
D2Mit10	D2Hun5	0	344
D2Hun5	D2Pri1	1	343
D2Hun5	Hoxd11	1	343
D2Hun5	Hoxd1	1	343
D2Hun5	Hoxd	1	343
D2Hun5	D2Mit247	1	343
D2Hun5	D2Mit418	1	343
D2Pri1	D2Mit219	1	343
Hoxd11	D2Mit219	1	343
Hoxd1	D2Mit219	1	343
Hoxd1	Hoxd	0	344
Hoxd	D2Mit219	1	343
D2Mit247	Hoxd11	0	344
D2Mit247	Hoxd	0	344
D2Mit247	D2Mit219	1	343
D2Mit247	D2Mit418	0	344
D2Mit418	Hoxd11	0	344
D2Mit418	Hoxd	0	344
D2Mit418	D2Mit219	1	343
D2Mit219	D2Mit435	5	339
D2Mit219	D2Mit93	5	339
D2Mit435	D2Mit183	0	178
D2Mit435	D2Mit246	0	178
D2Mit435	D2Mit299	0	178
D2Mit93	D2Mit183	0	178
D2Mit93	D2Mit246	0	178
D2Mit93	D2Mit299	0	178
D2Mit183	D2Mit159	1	177
D2Mit246	D2Mit159	1	177
D2Mit299	D2Mit159	1	177
D2Mit183	D2Mit160	1	177
D2Mit246	D2Mit160	1	177
D2Mit299	D2Mit160	1	177
D2Mit183	D2Mit248	1	177
D2Mit246	D2Mit248	1	177
D2Mit299	D2Mit248	1	177
D2Mit159	D2Mit128	2	176
D2Mit159	D2Mit14a	2	176
D2Mit159	Mdk	2	176
D2Mit160	D2Mit128	2	176
D2Mit160	D2Mit14a	2	176
D2Mit160	Mdk	2	176
D2Mit248	D2Mit128	2	176
D2Mit248	D2Mit14a	2	176
D2Mit248	Mdk	2	176

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit11	D2Mit10	5	344	1.453	0.645
D2Mit381	D2Mit10	5	344	1.453	0.645
D2Mit328	D2Mit10	5	344	1.453	0.645
D2Mit245	D2Mit10	5	344	1.453	0.645
D2Mit11	D2Hun5	5	344	1.453	0.645
D2Mit381	D2Hun5	5	344	1.453	0.645
D2Mit328	D2Hun5	5	344	1.453	0.645
D2Mit245	D2Hun5	5	344	1.453	0.645
D2Mit10	D2Pri1	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	Hoxd11	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	Hoxd1	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	Hoxd	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	D2Mit247	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	D2Mit418	1	344	0.291	0.290
D2Mit10	D2Hun5	0	344	0.000	0.000
D2Hun5	D2Pri1	1	344	0.291	0.290
D2Hun5	Hoxd11	1	344	0.291	0.290
D2Hun5	Hoxd1	1	344	0.291	0.290
D2Hun5	Hoxd	1	344	0.291	0.290
D2Hun5	D2Mit247	1	344	0.291	0.290
D2Hun5	D2Mit418	1	344	0.291	0.290
D2Pri1	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
Hoxd11	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
Hoxd1	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
Hoxd1	Hoxd	0	344	0.000	0.000
Hoxd	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
D2Mit247	Hoxd11	0	344	0.000	0.000
D2Mit247	Hoxd	0	344	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
D2Mit247	D2Mit418	0	344	0.000	0.000
D2Mit418	Hoxd11	0	344	0.000	0.000
D2Mit418	Hoxd	0	344	0.000	0.000
D2Mit418	D2Mit219	1	344	0.291	0.290
D2Mit219	D2Mit435	5	344	1.453	0.645
D2Mit219	D2Mit93	5	344	1.453	0.645
D2Mit435	D2Mit183	0	178	0.000	0.000
D2Mit435	D2Mit246	0	178	0.000	0.000
D2Mit435	D2Mit299	0	178	0.000	0.000
D2Mit93	D2Mit183	0	178	0.000	0.000
D2Mit93	D2Mit246	0	178	0.000	0.000
D2Mit93	D2Mit299	0	178	0.000	0.000
D2Mit183	D2Mit159	1	178	0.562	0.560
D2Mit246	D2Mit159	1	178	0.562	0.560
D2Mit299	D2Mit159	1	178	0.562	0.560
D2Mit183	D2Mit160	1	178	0.562	0.560
D2Mit246	D2Mit160	1	178	0.562	0.560
D2Mit299	D2Mit160	1	178	0.562	0.560
D2Mit183	D2Mit248	1	178	0.562	0.560
D2Mit246	D2Mit248	1	178	0.562	0.560
D2Mit299	D2Mit248	1	178	0.562	0.560
D2Mit159	D2Mit128	2	178	1.124	0.790
D2Mit159	D2Mit14a	2	178	1.124	0.790
D2Mit159	Mdk	2	178	1.124	0.790
D2Mit160	D2Mit128	2	178	1.124	0.790
D2Mit160	D2Mit14a	2	178	1.124	0.790
D2Mit160	Mdk	2	178	1.124	0.790
D2Mit248	D2Mit128	2	178	1.124	0.790
D2Mit248	D2Mit14a	2	178	1.124	0.790
D2Mit248	Mdk	2	178	1.124	0.790