Gene | Allele | Assay Type | Description |
---|---|---|---|
D2Mit11 | SSLP | ||
D2Mit245 | SSLP | ||
D2Pri1 | Southern analysis | FF1L | |
Evx2 | SSLP | Evx2F/Evx2R | |
Hoxd11 | SSLP | D2Tfv9f/D2Tfv9R | |
Hoxd10 | reported elsewhere | ||
Hoxd9 | PCR amplified length variant | D2Tfv11f/D2Tfv11R, D2Tfv10f/D2Tfv10R | |
Hoxd | visible phenotype | ||
D2Mit247 | SSLP | ||
D2Mit418 | SSLP | ||
D2Mit219 | SSLP | ||
D2Mit435 | SSLP | ||
D2Mit93 | SSLP | ||
D2Mit183 | SSLP | ||
D2Mit159 | SSLP | ||
D2Mit220 | SSLP | ||
D2Mit14a | SSLP |
Marker 1 | Marker 2 | # Recombinants | # Parentals |
---|---|---|---|
D2Mit11 | D2Mit245 | 7 | 542 |
D2Mit245 | D2Pri1 | 5 | 544 |
D2Mit245 | Evx2 | 5 | 544 |
D2Mit245 | Hoxd11 | 5 | 544 |
D2Mit245 | Hoxd10 | 5 | 544 |
D2Mit245 | Hoxd9 | 5 | 544 |
D2Mit245 | Hoxd | 5 | 544 |
D2Mit245 | D2Mit247 | 5 | 544 |
D2Mit245 | D2Mit418 | 5 | 544 |
D2Pri1 | D2Mit219 | 1 | 548 |
Evx2 | D2Mit219 | 1 | 548 |
Hoxd11 | D2Mit219 | 1 | 548 |
Hoxd10 | D2Mit219 | 1 | 548 |
Hoxd9 | D2Mit219 | 1 | 548 |
Evx2 | Hoxd | 0 | 549 |
Hoxd10 | Hoxd | 0 | 549 |
Hoxd9 | Hoxd | 0 | 549 |
Hoxd | D2Mit219 | 1 | 548 |
D2Mit247 | Hoxd11 | 0 | 549 |
D2Mit247 | Hoxd | 0 | 549 |
D2Mit247 | D2Mit219 | 1 | 548 |
D2Mit418 | Hoxd11 | 0 | 549 |
D2Mit418 | Hoxd | 0 | 549 |
D2Mit418 | D2Mit219 | 1 | 548 |
D2Mit219 | D2Mit435 | 7 | 542 |
D2Mit435 | D2Mit93 | 1 | 548 |
D2Mit93 | D2Mit183 | 1 | 548 |
D2Mit183 | D2Mit159 | 1 | 548 |
D2Mit159 | D2Mit220 | 4 | 545 |
D2Mit220 | D2Mit14a | 1 | 548 |
Marker 1 | Marker 2 | # Recombinants | Total | % Recombinants | Std Error |
---|---|---|---|---|---|
D2Mit11 | D2Mit245 | 7 | 549 | 1.275 | 0.479 |
D2Mit245 | D2Pri1 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | Evx2 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | Hoxd11 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | Hoxd10 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | Hoxd9 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | Hoxd | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | D2Mit247 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Mit245 | D2Mit418 | 5 | 549 | 0.911 | 0.405 |
D2Pri1 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Evx2 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Hoxd11 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Hoxd10 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Hoxd9 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Evx2 | Hoxd | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
Hoxd10 | Hoxd | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
Hoxd9 | Hoxd | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
Hoxd | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit247 | Hoxd11 | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
D2Mit247 | Hoxd | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
D2Mit247 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit418 | Hoxd11 | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
D2Mit418 | Hoxd | 0 | 549 | 0.000 | 0.000 |
D2Mit418 | D2Mit219 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit219 | D2Mit435 | 7 | 549 | 1.275 | 0.479 |
D2Mit435 | D2Mit93 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit93 | D2Mit183 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit183 | D2Mit159 | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
D2Mit159 | D2Mit220 | 4 | 549 | 0.729 | 0.363 |
D2Mit220 | D2Mit14a | 1 | 549 | 0.182 | 0.182 |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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