Symbol Name ID |
Cpgi12376
CpG island 12376 MGI:5677462 |
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SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
|
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|
BALB/cByJ
|
BALB/cJ
|
BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
|
BUB/BnJ
|
C3H/HeH
|
C3H/HeJ
|
C57BL/10J
|
C57BL/10SnJ
|
C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
C57BR/cdJ
|
C57L/J
|
C58/J
|
CAST/EiJ
|
CBA/J
|
CE/J
|
CZECHII/EiJ
|
DBA/1J
|
DBA/2J
|
FVB/NJ
|
I/LnJ
|
JF1/MsJ
|
KK/HlJ
|
LEWES/EiJ
|
LG/J
|
LP/J
|
MA/MyJ
|
MOLF/EiJ
|
NOD/ShiLtJ
|
NON/ShiLtJ
|
NZB/BlNJ
|
NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
|
PL/J
|
PWD/PhJ
|
PWK/PhJ
|
QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
|
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|
RIIIS/J
|
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|
SJL/J
|
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|
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|
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|
SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs224626847 MGI SNP Detail |
Chr2:147018304 | Cpgi12376 |
SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | |||||||||||
rs583300017 MGI SNP Detail |
Chr2:147018325 | Cpgi12376 |
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rs240430136 MGI SNP Detail |
Chr2:147018346 | Cpgi12376 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
rs264300652 MGI SNP Detail |
Chr2:147018391 | Cpgi12376 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr2:147018409 | Cpgi12376 |
SNP | A/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | ||
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Chr2:147018568 | Cpgi12376 |
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Chr2:147018580 | Cpgi12376 |
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Chr2:147018615 | Cpgi12376 |
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Chr2:147018627 | Cpgi12376 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | G | G | C | G | G | G | C | C | C | C | C | C | C | G | G | C | G | C | C | G | G | C | C | G | G | C | G | G | G | G | C | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | |||
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Chr2:147018700 | Cpgi12376 |
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rs583582773 MGI SNP Detail |
Chr2:147018721 | Cpgi12376 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
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rs240396647 MGI SNP Detail |
Chr2:147018755 | Cpgi12376 |
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rs387332895 MGI SNP Detail |
Chr2:147018800 | Cpgi12376 |
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Chr2:147018807 | Cpgi12376 |
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SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
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129S1/SvImJ
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129S5/SvEvBrd
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129X1/SvJ
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A/J
|
AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
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BALB/cByJ
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BALB/cJ
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BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
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C3H/HeH
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C3H/HeJ
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C57BL/10J
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C57BL/10SnJ
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C57BL/6J
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C57BL/6NJ
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C57BR/cdJ
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C57L/J
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C58/J
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CZECHII/EiJ
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QSi3/Ianm
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QSi5/Ianm
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ZALENDE/EiJ
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rs387533796 MGI SNP Detail |
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Chr2:147019071 | Cpgi12376 |
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Chr2:147019131 | Cpgi12376 |
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Chr2:147019148 | Cpgi12376 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
rs217874585 MGI SNP Detail |
Chr2:147019167 | Cpgi12376 |
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Chr2:147019221 | Cpgi12376 |
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SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
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129S1/SvImJ
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129S5/SvEvBrd
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129X1/SvJ
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A/J
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AKR/J
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B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
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BALB/cByJ
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|
C57BL/10SnJ
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C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
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|
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C58/J
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|
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CZECHII/EiJ
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FVB/NJ
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I/LnJ
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KK/HlJ
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LG/J
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MOLF/EiJ
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NZB/BlNJ
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QSi5/Ianm
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|
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rs32878425 MGI SNP Detail |
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SNP | C/G | G | G | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | ||
rs584141905 MGI SNP Detail |
Chr2:147019977 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
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rs265879244 MGI SNP Detail |
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SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | ||
rs233299068 MGI SNP Detail |
Chr2:147020091 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs33459651 MGI SNP Detail |
Chr2:147020162 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | T | C | T | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs33761385 MGI SNP Detail |
Chr2:147020282 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | A | G | A | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs232183431 MGI SNP Detail |
Chr2:147020295 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs244226437 MGI SNP Detail |
Chr2:147020302 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/C | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs213250129 MGI SNP Detail |
Chr2:147020345 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs33156324 MGI SNP Detail |
Chr2:147020359 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | G | A | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs108093808 MGI SNP Detail |
Chr2:147020407 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/T | A | T | T | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs226483627 MGI SNP Detail |
Chr2:147020442 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46738198 MGI SNP Detail |
Chr2:147020702 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs250145064 MGI SNP Detail |
Chr2:147020756 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | |||
rs27294769 MGI SNP Detail |
Chr2:147020785 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs262762812 MGI SNP Detail |
Chr2:147020816 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs49692606 MGI SNP Detail |
Chr2:147020843 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | G | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27294768 MGI SNP Detail |
Chr2:147020848 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | T | C | T | C | T | C | T | C | T | T | T | C | C | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs256700629 MGI SNP Detail |
Chr2:147020893 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | ||
rs27342865 MGI SNP Detail |
Chr2:147020936 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
|
BALB/cJ
|
BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
|
BUB/BnJ
|
C3H/HeH
|
C3H/HeJ
|
C57BL/10J
|
C57BL/10SnJ
|
C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
C57BR/cdJ
|
C57L/J
|
C58/J
|
CAST/EiJ
|
CBA/J
|
CE/J
|
CZECHII/EiJ
|
DBA/1J
|
DBA/2J
|
FVB/NJ
|
I/LnJ
|
JF1/MsJ
|
KK/HlJ
|
LEWES/EiJ
|
LG/J
|
LP/J
|
MA/MyJ
|
MOLF/EiJ
|
NOD/ShiLtJ
|
NON/ShiLtJ
|
NZB/BlNJ
|
NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
|
PL/J
|
PWD/PhJ
|
PWK/PhJ
|
QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
|
RF/J
|
RIIIS/J
|
SEA/GnJ
|
SJL/J
|
SM/J
|
SPRET/EiJ
|
ST/bJ
|
SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
rs27342864 MGI SNP Detail |
Chr2:147020937 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | G/T | G | G | T | G | T | G | T | G | T | G | T | T | T | G | G | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342863 MGI SNP Detail |
Chr2:147020954 | Cpgi12376 Cpgi12377 Nkx2-2 |
SNP | C/G | C | C | G | C | G | C | C | G | C | G | G | G | C | C | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342862 MGI SNP Detail |
Chr2:147021197 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | A | G | A | G | A | A | A | G | G | A | A | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs251223053 MGI SNP Detail |
Chr2:147021209 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/G | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342861 MGI SNP Detail |
Chr2:147021251 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | A | G | A | G | A | G | A | G | A | G | G | G | A | A | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342860 MGI SNP Detail |
Chr2:147021286 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | T | C | T | C | T | C | T | C | T | C | C | C | T | T | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs244983711 MGI SNP Detail |
Chr2:147021350 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | ||
rs46725263 MGI SNP Detail |
Chr2:147021422 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | T | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs234965346 MGI SNP Detail |
Chr2:147021447 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | ||||||||||||||||||||
rs27342859 MGI SNP Detail |
Chr2:147021683 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs226197882 MGI SNP Detail |
Chr2:147021788 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342858 MGI SNP Detail |
Chr2:147021823 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | C | C | T | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs582135393 MGI SNP Detail |
Chr2:147021827 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | ||
rs225008631 MGI SNP Detail |
Chr2:147021886 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | ||
rs27342857 MGI SNP Detail |
Chr2:147021897 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/T | T | A | T | A | T | A | T | A | T | A | A | A | T | T | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs27342856 MGI SNP Detail |
Chr2:147021930 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs223881942 MGI SNP Detail |
Chr2:147021934 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | G | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs258841624 MGI SNP Detail |
Chr2:147021961 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | ||
rs585936192 MGI SNP Detail |
Chr2:147022019 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | ||
rs260523855 MGI SNP Detail |
Chr2:147022027 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs579003193 MGI SNP Detail |
Chr2:147022035 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | |||||
rs218477294 MGI SNP Detail |
Chr2:147022036 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs241407607 MGI SNP Detail |
Chr2:147022063 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | C/T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs258472899 MGI SNP Detail |
Chr2:147022095 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/C | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs252258789 MGI SNP Detail |
Chr2:147022162 | Cpgi12376 Nkx2-2 |
SNP | A/G | G | G | G | A | G | G | A | A | G | A | A | A | G | G | G | G | G | G | G | A | A | G | G | G | G | A | A | G | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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