Mouse SNP Summary
|
Symbol Name ID |
Tssr5799
transcription start site region 5799 MGI:5933566 |
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SNPs to Text File
| SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129/Sv
|
129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
|
BALB/cJ
|
BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
|
BUB/BnJ
|
C3H/HeH
|
C3H/HeJ
|
C57BL/10J
|
C57BL/10SnJ
|
C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
C57BR/cdJ
|
C57L/J
|
C58/J
|
CAST/EiJ
|
CBA/J
|
CE/J
|
CZECHII/EiJ
|
DBA/1J
|
DBA/2J
|
FVB/NJ
|
I/LnJ
|
JF1/MsJ
|
KK/HlJ
|
LEWES/EiJ
|
LG/J
|
LP/J
|
MA/MyJ
|
MOLF/EiJ
|
NOD/ShiLtJ
|
NON/ShiLtJ
|
NZB/BlNJ
|
NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
|
PL/J
|
PWD/PhJ
|
PWK/PhJ
|
QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
|
RF/J
|
RIIIS/J
|
SEA/GnJ
|
SJL/J
|
SM/J
|
SPRET/EiJ
|
ST/bJ
|
SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs108120124 MGI SNP Detail |
Chr1:4839376 | Tssr5799 |
SNP | T | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs108649345 MGI SNP Detail |
Chr1:4839378 | Tssr5799 |
SNP | C | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs253942504 MGI SNP Detail |
Chr1:4839400 | Tssr5799 |
SNP | G/T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | |||
| rs587112585 MGI SNP Detail |
Chr1:4839486 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | |||
| rs580014323 MGI SNP Detail |
Chr1:4839520 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | ||||
| rs219328049 MGI SNP Detail |
Chr1:4839570 | Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | |||
| rs39833869 MGI SNP Detail |
Chr1:4839589 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | G | G | G | G | A | A | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs38145888 MGI SNP Detail |
Chr1:4839590 | Tssr5799 |
SNP | A/C | C | C | C | C | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs221157119 MGI SNP Detail |
Chr1:4839630 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | |||
| rs250010052 MGI SNP Detail |
Chr1:4839646 | Tssr5799 |
SNP | A/T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | |||||
| rs36282439 MGI SNP Detail |
Chr1:4839648 | Tssr5799 |
SNP | A/T | A | A | A | A | T | T | T | T | A | T | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36964405 MGI SNP Detail |
Chr1:4839755 | Tssr5799 |
SNP | A/T | A | A | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36928447 MGI SNP Detail |
Chr1:4839785 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs253784732 MGI SNP Detail |
Chr1:4839947 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs586672301 MGI SNP Detail |
Chr1:4839951 | Tssr5799 |
SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | ||||||||||||||
| rs580845256 MGI SNP Detail |
Chr1:4839954 | Tssr5799 |
SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | |||||||||||||
| rs584037750 MGI SNP Detail |
Chr1:4839961 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | ||||||||||||||
| rs255355363 MGI SNP Detail |
Chr1:4840109 | Tssr5799 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | |||
| rs225381435 MGI SNP Detail |
Chr1:4840152 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | |||
| rs39120686 MGI SNP Detail |
Chr1:4840174 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | A | A | A | A | G | A | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs39397349 MGI SNP Detail |
Chr1:4840303 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36729542 MGI SNP Detail |
Chr1:4840418 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36345379 MGI SNP Detail |
Chr1:4840421 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | T | T | C | T | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs234257490 MGI SNP Detail |
Chr1:4840496 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
| rs247619650 MGI SNP Detail |
Chr1:4840534 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | |||
| SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
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129S1/SvImJ
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129S5/SvEvBrd
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129/Sv
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129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
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B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
|
BALB/cJ
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BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
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BUB/BnJ
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C3H/HeH
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C3H/HeJ
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C57BL/10J
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C57BL/10SnJ
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C57BL/6J
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C57BL/6NJ
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C57BR/cdJ
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C57L/J
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C58/J
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CAST/EiJ
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CBA/J
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CE/J
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CZECHII/EiJ
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DBA/1J
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DBA/2J
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FVB/NJ
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I/LnJ
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JF1/MsJ
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KK/HlJ
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LEWES/EiJ
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LG/J
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LP/J
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MA/MyJ
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MOLF/EiJ
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NOD/ShiLtJ
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NON/ShiLtJ
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NZB/BlNJ
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NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
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PL/J
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PWD/PhJ
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PWK/PhJ
|
QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
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RF/J
|
RIIIS/J
|
SEA/GnJ
|
SJL/J
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SM/J
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SPRET/EiJ
|
ST/bJ
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SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
| rs37268343 MGI SNP Detail |
Chr1:4840546 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37864282 MGI SNP Detail |
Chr1:4840551 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | A | A | A | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36438669 MGI SNP Detail |
Chr1:4840605 | Tssr5799 |
SNP | A/C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37497265 MGI SNP Detail |
Chr1:4840614 | Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs260945015 MGI SNP Detail |
Chr1:4840648 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs239296474 MGI SNP Detail |
Chr1:4840653 | Tssr5799 |
SNP | A/T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | |||
| rs222193728 MGI SNP Detail |
Chr1:4840669 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36726228 MGI SNP Detail |
Chr1:4840712 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36900512 MGI SNP Detail |
Chr1:4840861 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | A | A | G | A | G | G | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs255368777 MGI SNP Detail |
Chr1:4840882 | Tssr5799 |
SNP | A/C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | |||
| rs38802315 MGI SNP Detail |
Chr1:4840916 | Tssr5799 |
SNP | A/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs243950405 MGI SNP Detail |
Chr1:4840929 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | |||
| rs32320922 MGI SNP Detail |
Chr1:4840944 | Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs229310760 MGI SNP Detail |
Chr1:4840984 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | |||
| rs247726897 MGI SNP Detail |
Chr1:4841014 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | |||
| rs36362883 MGI SNP Detail |
Chr1:4841137 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31967277 MGI SNP Detail |
Chr1:4841204 | Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | C | C | C | C | C | T | T | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs52336048 MGI SNP Detail |
Chr1:4841250 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32729159 MGI SNP Detail |
Chr1:4841274 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | G | G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37699919 MGI SNP Detail |
Chr1:4841278 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | A | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs214012979 MGI SNP Detail |
Chr1:4841379 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | |||
| rs36847247 MGI SNP Detail |
Chr1:4841402 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs582281999 MGI SNP Detail |
Chr1:4841414 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
| rs226972269 MGI SNP Detail |
Chr1:4841447 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
| rs31989549 MGI SNP Detail |
Chr1:4841457 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/T | A | A | A | A | A | T | T | T | A | A | A | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
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129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
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129/Sv
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129X1/SvJ
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A/J
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AKR/J
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B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
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BALB/cJ
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BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
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BUB/BnJ
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C3H/HeH
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C3H/HeJ
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C57BL/10J
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C57BL/10SnJ
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C57BL/6J
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C57BL/6NJ
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C57BR/cdJ
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C57L/J
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C58/J
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CAST/EiJ
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CBA/J
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CE/J
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CZECHII/EiJ
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DBA/1J
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DBA/2J
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FVB/NJ
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I/LnJ
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JF1/MsJ
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KK/HlJ
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LEWES/EiJ
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LG/J
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LP/J
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MA/MyJ
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MOLF/EiJ
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NOD/ShiLtJ
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NON/ShiLtJ
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NZB/BlNJ
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NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
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PL/J
|
PWD/PhJ
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PWK/PhJ
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QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
|
RF/J
|
RIIIS/J
|
SEA/GnJ
|
SJL/J
|
SM/J
|
SPRET/EiJ
|
ST/bJ
|
SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
| rs36769413 MGI SNP Detail |
Chr1:4841469 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs241693041 MGI SNP Detail |
Chr1:4841488 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | |||
| rs36763890 MGI SNP Detail |
Chr1:4841497 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs214937421 MGI SNP Detail |
Chr1:4841503 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | |||
| rs233483377 MGI SNP Detail |
Chr1:4841538 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | |||
| rs31958422 MGI SNP Detail |
Chr1:4841648 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | G/T | T | T | T | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37733949 MGI SNP Detail |
Chr1:4841680 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | C | T | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36482242 MGI SNP Detail |
Chr1:4841701 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | T | C | C | C | T | T | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs241203908 MGI SNP Detail |
Chr1:4841745 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | |||
| rs261526861 MGI SNP Detail |
Chr1:4841800 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | |||
| rs221665061 MGI SNP Detail |
Chr1:4841812 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | |||
| rs250208407 MGI SNP Detail |
Chr1:4841836 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | G/T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | |||
| rs31614417 MGI SNP Detail |
Chr1:4841852 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32718983 MGI SNP Detail |
Chr1:4841876 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | G/T | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37493581 MGI SNP Detail |
Chr1:4841908 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230162 MGI SNP Detail |
Chr1:4841926 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230163 MGI SNP Detail |
Chr1:4841936 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | G | A | G | A | G | A | A | A | A | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230164 MGI SNP Detail |
Chr1:4841976 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/G | G | G | G | G | G | C | G | C | C | C | G | G | C | G | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230165 MGI SNP Detail |
Chr1:4842073 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230166 MGI SNP Detail |
Chr1:4842148 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | A | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230167 MGI SNP Detail |
Chr1:4842165 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | G | G | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs214859023 MGI SNP Detail |
Chr1:4842169 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | ||||
| rs4230168 MGI SNP Detail |
Chr1:4842210 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | A | G | ? | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36328050 MGI SNP Detail |
Chr1:4842232 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | C | C | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230169 MGI SNP Detail |
Chr1:4842233 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | A | ? | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129/Sv
|
129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
|
BALB/cJ
|
BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
|
BUB/BnJ
|
C3H/HeH
|
C3H/HeJ
|
C57BL/10J
|
C57BL/10SnJ
|
C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
C57BR/cdJ
|
C57L/J
|
C58/J
|
CAST/EiJ
|
CBA/J
|
CE/J
|
CZECHII/EiJ
|
DBA/1J
|
DBA/2J
|
FVB/NJ
|
I/LnJ
|
JF1/MsJ
|
KK/HlJ
|
LEWES/EiJ
|
LG/J
|
LP/J
|
MA/MyJ
|
MOLF/EiJ
|
NOD/ShiLtJ
|
NON/ShiLtJ
|
NZB/BlNJ
|
NZO/HlLtJ
|
NZW/LacJ
|
PL/J
|
PWD/PhJ
|
PWK/PhJ
|
QSi3/Ianm
|
QSi5/Ianm
|
RF/J
|
RIIIS/J
|
SEA/GnJ
|
SJL/J
|
SM/J
|
SPRET/EiJ
|
ST/bJ
|
SWR/J
|
WSB/EiJ
|
ZALENDE/EiJ
|
| rs4230170 MGI SNP Detail |
Chr1:4842243 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32068775 MGI SNP Detail |
Chr1:4842299 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs226128858 MGI SNP Detail |
Chr1:4842309 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | ||||||
| rs4230171 MGI SNP Detail |
Chr1:4842313 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs584764006 MGI SNP Detail |
Chr1:4842411 | Gm6123 Tssr5799 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | |||
| rs38285019 MGI SNP Detail |
Chr1:4842425 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36667141 MGI SNP Detail |
Chr1:4842462 | Tssr5799 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37631080 MGI SNP Detail |
Chr1:4842469 | Tssr5799 |
SNP | G/T | G | G | T | T | G | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32588711 MGI SNP Detail |
Chr1:4842474 | Tssr5799 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs257710054 MGI SNP Detail |
Chr1:4842494 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | ||||
| rs578679443 MGI SNP Detail |
Chr1:4842495 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | |||
| rs32684455 MGI SNP Detail |
Chr1:4842518 | Tssr5799 |
SNP | C/T | C | C | C | C | T | C | T | T | C | C | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs36271380 MGI SNP Detail |
Chr1:4842546 | Tssr5799 |
SNP | C/G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs37115265 MGI SNP Detail |
Chr1:4842581 | Tssr5799 |
SNP | G/T | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs262159504 MGI SNP Detail |
Chr1:4842653 | Tssr5799 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | G | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | G | |||||||||||||||||
| rs234510027 MGI SNP Detail |
Chr1:4842703 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | |||||||||
| rs247778735 MGI SNP Detail |
Chr1:4842735 | Tssr5799 |
SNP | A/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | ||||||
| rs38421687 MGI SNP Detail |
Chr1:4842764 | Tssr5799 |
SNP | A/C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs581970509 MGI SNP Detail |
Chr1:4842821 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | |||||||||
| rs256908545 MGI SNP Detail |
Chr1:4842875 | Tssr5799 |
SNP | G/T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | |||
| rs227266231 MGI SNP Detail |
Chr1:4842915 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | |||
| rs243617265 MGI SNP Detail |
Chr1:4842970 | Tssr5799 |
SNP | C/G | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | |||
| rs229386318 MGI SNP Detail |
Chr1:4842992 | Tssr5799 |
SNP | C/T | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs256273783 MGI SNP Detail |
Chr1:4842993 | Tssr5799 |
SNP | A/G | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs253963344 MGI SNP Detail |
Chr1:4843024 | Tssr5799 |
SNP | A/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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