Symbol Name ID |
Tssr12870
transcription start site region 12870 MGI:5940637 |
Loading... |
SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
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129S5/SvEvBrd
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129X1/SvJ
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AKR/J
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|
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BALB/cJ
|
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|
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C3H/HeH
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C3H/HeJ
|
C57BL/10J
|
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C57BL/6J
|
C57BL/6NJ
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
FVB/NJ
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I/LnJ
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|
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|
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|
LG/J
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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Chr1:88190573 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | C | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88190661 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/G | C | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88190781 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88190815 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88190921 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88191018 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191021 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191035 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191037 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | T | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs108795251 MGI SNP Detail |
Chr1:88191091 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191142 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191152 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191155 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88191173 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88191189 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88191192 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs48737417 MGI SNP Detail |
Chr1:88191200 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs45981244 MGI SNP Detail |
Chr1:88191237 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191281 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs13472324 MGI SNP Detail |
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SNP | A/G | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs13472326 MGI SNP Detail |
Chr1:88191320 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129X1/SvJ
|
A/J
|
AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
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BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
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|
QSi5/Ianm
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rs13472323 MGI SNP Detail |
Chr1:88191468 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/G | C | G | C | G | C | G | G | C | C | G | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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rs580600732 MGI SNP Detail |
Chr1:88191541 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191580 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88191586 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46250955 MGI SNP Detail |
Chr1:88191621 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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rs251184521 MGI SNP Detail |
Chr1:88191992 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs30301546 MGI SNP Detail |
Chr1:88191993 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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Chr1:88192018 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs46381394 MGI SNP Detail |
Chr1:88192098 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs252922039 MGI SNP Detail |
Chr1:88192107 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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rs49167126 MGI SNP Detail |
Chr1:88192243 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs48671593 MGI SNP Detail |
Chr1:88192250 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
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129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129X1/SvJ
|
A/J
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AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
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BALB/cJ
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BTBR T<+> Itpr3<tf>/J
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C3H/HeH
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C3H/HeJ
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C57BL/10J
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C57BL/10SnJ
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C57BL/6J
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C57BL/6NJ
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C57BR/cdJ
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C58/J
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DBA/2J
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MOLF/EiJ
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NZB/BlNJ
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QSi5/Ianm
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|
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|
rs47952313 MGI SNP Detail |
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SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Chr1:88192318 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs46388632 MGI SNP Detail |
Chr1:88192377 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs50198775 MGI SNP Detail |
Chr1:88192399 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs247331970 MGI SNP Detail |
Chr1:88192406 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs47009044 MGI SNP Detail |
Chr1:88192444 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs228157526 MGI SNP Detail |
Chr1:88192450 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||
rs51813251 MGI SNP Detail |
Chr1:88192461 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/C | C | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs47686199 MGI SNP Detail |
Chr1:88192467 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46872995 MGI SNP Detail |
Chr1:88192470 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs51782943 MGI SNP Detail |
Chr1:88192482 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | T | T | T | T | C | T | T | C | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs51686442 MGI SNP Detail |
Chr1:88192494 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46709090 MGI SNP Detail |
Chr1:88192527 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46408900 MGI SNP Detail |
Chr1:88192568 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs47221676 MGI SNP Detail |
Chr1:88192576 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs47614041 MGI SNP Detail |
Chr1:88192657 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | T | T | T | T | C | C | T | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs46949386 MGI SNP Detail |
Chr1:88192699 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs49629258 MGI SNP Detail |
Chr1:88192700 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs236870015 MGI SNP Detail |
Chr1:88192749 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs49585932 MGI SNP Detail |
Chr1:88192750 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | A | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs51185680 MGI SNP Detail |
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rs251241581 MGI SNP Detail |
Chr1:88192786 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs46614948 MGI SNP Detail |
Chr1:88192819 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
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rs52013883 MGI SNP Detail |
Chr1:88192830 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNP ID (GRCm39) |
Map Position (GRCm39) |
Gene & Category | Variation Type |
Allele Summary (all strains) |
129P2/OlaHsd
|
129S1/SvImJ
|
129S5/SvEvBrd
|
129X1/SvJ
|
A/J
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AKR/J
|
B10.RIII-H2<r> H2-T18<b>/(71NS)SnJ
|
BALB/cByJ
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C3H/HeH
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|
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|
NZO/HlLtJ
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NZW/LacJ
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PL/J
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PWD/PhJ
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QSi3/Ianm
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QSi5/Ianm
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RF/J
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RIIIS/J
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SEA/GnJ
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SJL/J
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SM/J
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SPRET/EiJ
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ST/bJ
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SWR/J
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WSB/EiJ
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ZALENDE/EiJ
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rs30301545 MGI SNP Detail |
Chr1:88192844 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | A | G | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs252963561 MGI SNP Detail |
Chr1:88192874 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||
rs219859778 MGI SNP Detail |
Chr1:88192882 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||
rs47391027 MGI SNP Detail |
Chr1:88192883 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/G | G | C | C | C | C | C | C | G | C | C | G | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs587512004 MGI SNP Detail |
Chr1:88192886 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||
rs45726911 MGI SNP Detail |
Chr1:88192932 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs256846644 MGI SNP Detail |
Chr1:88192933 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||
rs222555958 MGI SNP Detail |
Chr1:88192937 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||
rs49610249 MGI SNP Detail |
Chr1:88192939 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs50259481 MGI SNP Detail |
Chr1:88192976 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G/T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs13472325 MGI SNP Detail |
Chr1:88192980 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | T | C | C | T | C | C | T | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs48703577 MGI SNP Detail |
Chr1:88192993 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/C | C | C | ? | A | A | A | A | C | A | C | A | A | C | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs49279202 MGI SNP Detail |
Chr1:88193001 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs51036182 MGI SNP Detail |
Chr1:88193002 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs48034726 MGI SNP Detail |
Chr1:88193005 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/T | A | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs50378893 MGI SNP Detail |
Chr1:88193031 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs242333299 MGI SNP Detail |
Chr1:88193133 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||
rs108848196 MGI SNP Detail |
Chr1:88193166 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs261338709 MGI SNP Detail |
Chr1:88193167 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||
rs227710616 MGI SNP Detail |
Chr1:88193265 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | |||||||||||
rs30301544 MGI SNP Detail |
Chr1:88193292 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/T | T | A | A | T | A | T | A | T | T | A | A | A | T | A | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
rs262456775 MGI SNP Detail |
Chr1:88193390 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||
rs231332448 MGI SNP Detail |
Chr1:88193434 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | A/G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||
rs245160652 MGI SNP Detail |
Chr1:88193543 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | ||||||||||||||||||||
rs215779318 MGI SNP Detail |
Chr1:88193546 | Hjurp Rr35066 Tssr12870 |
SNP | C/T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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last database update 12/17/2024 MGI 6.24 |
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